More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0096 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  100 
 
 
52 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_002950  PG0656  50S ribosomal protein L34  87.5 
 
 
50 aa  85.1  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  87.23 
 
 
52 aa  82  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.185024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  85.11 
 
 
55 aa  81.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1055  ribosomal protein L34  82.98 
 
 
51 aa  80.5  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15136  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  83.33 
 
 
53 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3852  ribosomal protein L34  80.85 
 
 
52 aa  78.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  82.98 
 
 
52 aa  77.4  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  77.08 
 
 
52 aa  75.9  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  71.15 
 
 
53 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  72 
 
 
51 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2338  50S ribosomal protein L34  72.92 
 
 
53 aa  73.6  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2743  50S ribosomal protein L34  69.23 
 
 
53 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  67.31 
 
 
53 aa  71.2  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916972  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0100  50S ribosomal protein L34  76.09 
 
 
53 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  70.21 
 
 
48 aa  68.9  0.00000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2564  50S ribosomal protein L34  64.58 
 
 
53 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  72.34 
 
 
52 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  72.34 
 
 
47 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  72.34 
 
 
48 aa  65.5  0.0000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  77.27 
 
 
44 aa  65.5  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2763  ribosomal protein L34  68.09 
 
 
52 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000022911  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2138  ribosomal protein L34  74.42 
 
 
44 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  75 
 
 
44 aa  65.5  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 
46 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 
46 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  75 
 
 
44 aa  64.3  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  75 
 
 
44 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5598  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5341  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000589989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5185  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165607  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  73.33 
 
 
46 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  72.73 
 
 
44 aa  62.8  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5738  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0731881  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3336  50S ribosomal protein L34P  74.42 
 
 
44 aa  63.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.754449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  75 
 
 
44 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5320  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0132  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  62.8  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5281  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5615  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4028  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2512  50S ribosomal protein L34  78.57 
 
 
45 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197783  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 
44 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2147  50S ribosomal protein L34  75 
 
 
44 aa  62  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  2.00251e-17  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0001  50S ribosomal protein L34  75 
 
 
44 aa  62  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283755  hitchhiker  0.00000000552795 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0002  50S ribosomal protein L34  75 
 
 
44 aa  62  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000727123  unclonable  0.0000468434 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  61.6  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2353  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3321  50S ribosomal protein L34P  74.42 
 
 
44 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  61.2  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2310  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093766 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0357  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 
44 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.0448083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2632  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 
46 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.486459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3614  50S ribosomal protein L34P  70.45 
 
 
44 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1719  hypothetical protein  82.98 
 
 
52 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.694147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  61.2  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0446  50S ribosomal protein L34  65.96 
 
 
51 aa  60.8  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3946  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  61.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3101  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000038228 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3102  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0409092 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0104  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3400  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.812666  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6523  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3238  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0090  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2238  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3157  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107148 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2847  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.565052  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4463  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404373  normal  0.0831526 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2552  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941562  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3184  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.278531 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3553  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3218  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535057  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3989  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3166  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.667322  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1046  ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  60.1  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0456047  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0301  ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2577  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
44 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1787  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000418324  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0005  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 
44 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000814875  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1041  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00984353  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1793  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000343039  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0984  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0751945  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1787  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0214193  normal  0.25456 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00438  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 
44 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0081  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
44 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002013  LSU ribosomal protein L34p  69.77 
 
 
44 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000014236  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  58.9  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 
44 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2088  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149936  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3760  50S ribosomal protein L34P  72.09 
 
 
44 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>