279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0201 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0201  50S ribosomal protein L34  100 
 
 		 44 aa  87.4  6e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0578075  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0333  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0313  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0642  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 45 aa  62.8  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0779335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2720  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.054761 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1059  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.202626  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0070  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0583  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.0000248165  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0440  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.046605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3614  50S ribosomal protein L34P  70.45 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2603  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 46 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15416  normal  0.859083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3505  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0561624 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0097  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3089  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1923  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360923  normal  0.510099 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1363  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0081  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3336  50S ribosomal protein L34P  63.64 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.754449  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0856  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2632  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2353  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2310  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093766 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0872  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 45 aa  57.4  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2138  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1021  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.797032  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0962  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0082  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376077 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3321  50S ribosomal protein L34P  67.44 
 
 		 44 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1046  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0456047  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0357  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.0448083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0575  50S ribosomal protein L34P  63.64 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0374  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0301  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0036  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.398714 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 46 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0035  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.766539  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4487  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849089  hitchhiker  0.00000000110171 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00438  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002013  LSU ribosomal protein L34p  62.79 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000014236  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2147  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  2.00251e-17  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0002  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000727123  unclonable  0.0000468434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2577  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0001  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283755  hitchhiker  0.00000000552795 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 55 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  58.14 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  58.14 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  58.14 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 46 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3705  50S ribosomal protein L34  74.19 
 
 		 44 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 46 aa  51.6  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 46 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  58.14 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2564  50S ribosomal protein L34  56.82 
 
 		 53 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  56.82 
 
 		 44 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2827  50S ribosomal protein L34P  55.81 
 
 		 44 aa  51.2  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3076  50S ribosomal protein L34  70.97 
 
 		 44 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3326  ribosomal protein L34  70.97 
 
 		 44 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491584  normal  0.0296348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0685  50S ribosomal protein L34  70.97 
 
 		 44 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0638  50S ribosomal protein L34  70.97 
 
 		 44 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257462  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5079  50S ribosomal protein L34  70.97 
 
 		 44 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0046  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  51.2  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  56.82 
 
 		 44 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0819  50S ribosomal protein L34  70.97 
 
 		 44 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2512  50S ribosomal protein L34  64.29 
 
 		 45 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197783  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27040  LSU ribosomal protein L34P  62.79 
 
 		 45 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  56.82 
 
 		 51 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2038  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  50.8  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2414  ribosomal protein L34  55.81 
 
 		 44 aa  50.4  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00945499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1194  ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 57 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000000642694  decreased coverage  0.000208827 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0005  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 44 aa  50.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000814875  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7324  50S ribosomal subunit protein L34  67.74 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0007  50S ribosomal protein L34  76.67 
 
 		 45 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  58.14 
 
 		 44 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 52 aa  50.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  59.09 
 
 		 52 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4138  ribosomal protein L34  53.49 
 
 		 45 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00368218  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7341  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 45 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0551  50S ribosomal protein L34  54.55 
 
 		 44 aa  50.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0649  50S ribosomal protein L34  52.27 
 
 		 44 aa  49.3  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.485643  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0820  50S ribosomal protein L34  54.55 
 
 		 44 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1041  50S ribosomal protein L34  54.55 
 
 		 44 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00984353  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2338  50S ribosomal protein L34  58.14 
 
 		 53 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3077  50S ribosomal protein L34  74.19 
 
 		 44 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2933  50S ribosomal protein L34  74.19 
 
 		 44 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1228  ribosomal protein L34  70.97 
 
 		 46 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0260581  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3778  50S ribosomal protein L34  76.67 
 
 		 45 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000138281  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2243  50S ribosomal protein L34  54.55 
 
 		 44 aa  48.9  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.914999  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0984  50S ribosomal protein L34  54.55 
 
 		 44 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0751945  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4524  50S ribosomal protein L34  76.67 
 
 		 45 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000909572  hitchhiker  0.00010277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4382  50S ribosomal protein L34  76.67 
 
 		 45 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000590105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>