More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2338 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2338  50S ribosomal protein L34  100 
 
 		 53 aa  103  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2564  50S ribosomal protein L34  84.91 
 
 		 53 aa  92  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2743  50S ribosomal protein L34  86.79 
 
 		 53 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  81.13 
 
 		 53 aa  88.2  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916972  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  86 
 
 		 53 aa  87.8  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  87.5 
 
 		 51 aa  86.7  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  84 
 
 		 53 aa  85.9  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  82.61 
 
 		 52 aa  74.7  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.185024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  76.09 
 
 		 55 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  72.92 
 
 		 52 aa  73.6  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_002950  PG0656  50S ribosomal protein L34  76.09 
 
 		 50 aa  72.8  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  78.26 
 
 		 52 aa  71.6  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  75 
 
 		 52 aa  71.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  77.78 
 
 		 48 aa  69.7  0.00000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1055  ribosomal protein L34  71.74 
 
 		 51 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3852  ribosomal protein L34  70.21 
 
 		 52 aa  69.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0100  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 		 53 aa  68.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0132  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2763  ribosomal protein L34  70.21 
 
 		 52 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000022911  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 		 46 aa  63.9  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  69.57 
 
 		 52 aa  63.5  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2147  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  2.00251e-17  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  73.33 
 
 		 46 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  73.33 
 
 		 46 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0002  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000727123  unclonable  0.0000468434 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  69.57 
 
 		 47 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0001  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283755  hitchhiker  0.00000000552795 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 		 44 aa  63.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2577  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  65.22 
 
 		 48 aa  61.2  0.000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0333  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3946  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  68.18 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  70.45 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0313  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002013  LSU ribosomal protein L34p  69.77 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000014236  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3321  50S ribosomal protein L34P  67.44 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0642  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 45 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0779335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00438  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3760  50S ribosomal protein L34P  69.05 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1793  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000343039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2950  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000318423  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27040  LSU ribosomal protein L34P  67.44 
 
 		 45 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2038  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2720  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.054761 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0070  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1041  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00984353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5341  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000589989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5185  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165607  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0820  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4028  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5598  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1059  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.202626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5738  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0731881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5320  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5281  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0984  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0751945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5615  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106423  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 46 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486459 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4487  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849089  hitchhiker  0.00000000110171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4432  50S ribosomal protein L34  59.57 
 
 		 49 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3626  50S ribosomal protein L34  61.7 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118828  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3336  50S ribosomal protein L34P  65.12 
 
 		 44 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.754449  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0005  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  57  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000814875  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0872  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 		 45 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0446  50S ribosomal protein L34  65.22 
 
 		 51 aa  56.6  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1194  ribosomal protein L34  66.67 
 
 		 57 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000000642694  decreased coverage  0.000208827 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2512  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 		 45 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197783  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9056  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 45 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00101546  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0649  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.485643  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0046  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0092  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2065  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000217746  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1787  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000418324  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4172  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 45 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000696082  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0097  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3034  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3489  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3614  50S ribosomal protein L34P  61.36 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1437  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0553  50S ribosomal protein L34  56.82 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1540  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000041199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>