More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1041 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1041  50S ribosomal protein L34  100 
 
 
44 aa  87  8e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00984353  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0984  50S ribosomal protein L34  100 
 
 
44 aa  87  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0751945  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0820  50S ribosomal protein L34  100 
 
 
44 aa  87  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0553  50S ribosomal protein L34  93.18 
 
 
44 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2243  50S ribosomal protein L34  90.91 
 
 
44 aa  80.5  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.914999  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0551  50S ribosomal protein L34  90.91 
 
 
44 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0649  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 
44 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.485643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3553  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 
44 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3102  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 
44 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0409092 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2238  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 
44 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3400  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 
44 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.812666  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3184  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 
44 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.278531 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0090  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 
44 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0104  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 
44 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6523  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 
44 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3989  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 
44 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3238  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 
44 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303962  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1787  50S ribosomal protein L34  84.09 
 
 
44 aa  72.8  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0214193  normal  0.25456 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4463  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 
44 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404373  normal  0.0831526 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2552  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 
44 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941562  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2088  50S ribosomal protein L34  84.09 
 
 
44 aa  72.8  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2847  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 
44 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.565052  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3218  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 
44 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3157  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 
44 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3101  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 
44 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000038228 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3166  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 
44 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.667322  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3463  50S ribosomal protein L34  84.09 
 
 
44 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00766604  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  79.55 
 
 
44 aa  70.5  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0001  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
44 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.549372  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3760  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
44 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3461  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
44 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6059  50S ribosomal protein L34  84.09 
 
 
44 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0823674  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2827  50S ribosomal protein L34P  81.82 
 
 
44 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3545  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
44 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4143  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
44 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5015  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
44 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4796  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
44 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  77.27 
 
 
44 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00438  50S ribosomal protein L34  79.07 
 
 
44 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4245  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 
44 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000109099  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002013  LSU ribosomal protein L34p  79.07 
 
 
44 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000014236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4432  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 
49 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2414  ribosomal protein L34  77.27 
 
 
44 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00945499  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3626  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 
49 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118828  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  75 
 
 
44 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3828  50S ribosomal protein L34P  75 
 
 
44 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  75 
 
 
44 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0005  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 
44 aa  64.3  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000814875  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5302  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 
44 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2512  50S ribosomal protein L34  76.19 
 
 
45 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197783  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4204  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 
44 aa  63.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000294632  decreased coverage  0.00182284 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4388  ribosomal protein L34  75 
 
 
44 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000381173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2779  ribosomal protein L34  77.27 
 
 
45 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0322855  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4908  50S ribosomal protein L34  75 
 
 
44 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2334  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 
44 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4116  50S ribosomal protein L34  75 
 
 
44 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0205607  normal  0.0561719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0313  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.8  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  73.81 
 
 
44 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  70.45 
 
 
44 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2603  ribosomal protein L34  72.09 
 
 
46 aa  60.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15416  normal  0.859083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1055  ribosomal protein L34  68.18 
 
 
51 aa  60.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15136  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3034  ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3489  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
51 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0081  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  60.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 
44 aa  60.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3089  ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.5  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0097  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0132  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  60.1  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0082  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.376077 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0333  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
44 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  70.45 
 
 
44 aa  58.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 
53 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
53 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916972  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
52 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0870  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  58.5  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
46 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3321  50S ribosomal protein L34P  69.77 
 
 
44 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3760  50S ribosomal protein L34P  73.81 
 
 
44 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
46 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2138  ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2353  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2310  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093766 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2720  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
44 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.054761 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1059  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
44 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.202626  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0070  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
44 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2564  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 
53 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2632  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0872  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 
45 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
44 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682.1  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 
44 aa  57.8  0.00000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
44 aa  57.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
46 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2338  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 
53 aa  57.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.13668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>