298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2564 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2564  50S ribosomal protein L34  100 
 
 		 53 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2338  50S ribosomal protein L34  84.91 
 
 		 53 aa  92  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  91.67 
 
 		 51 aa  91.7  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  84 
 
 		 53 aa  86.3  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  80 
 
 		 53 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916972  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2743  50S ribosomal protein L34  80 
 
 		 53 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  74 
 
 		 53 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  68.09 
 
 		 55 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  72.34 
 
 		 52 aa  71.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.185024 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  72.34 
 
 		 52 aa  70.9  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  70.83 
 
 		 52 aa  70.9  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3852  ribosomal protein L34  68.09 
 
 		 52 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_002950  PG0656  50S ribosomal protein L34  64.58 
 
 		 50 aa  68.6  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  64.58 
 
 		 52 aa  68.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1055  ribosomal protein L34  65.96 
 
 		 51 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0100  50S ribosomal protein L34  69.57 
 
 		 53 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  65.96 
 
 		 48 aa  65.1  0.0000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0333  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  61.7 
 
 		 47 aa  61.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0313  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  59.62 
 
 		 52 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2763  ribosomal protein L34  65.96 
 
 		 52 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000022911  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0642  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 45 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0779335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0132  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0001  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283755  hitchhiker  0.00000000552795 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2147  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  2.00251e-17  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0002  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000727123  unclonable  0.0000468434 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0046  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00438  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002013  LSU ribosomal protein L34p  69.77 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000014236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2577  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 		 46 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2038  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1437  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0820  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1041  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00984353  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0984  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0751945  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  64.44 
 
 		 46 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  64.44 
 
 		 46 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27040  LSU ribosomal protein L34P  62.79 
 
 		 45 aa  57  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  65.91 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0828  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 47 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1059  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.202626  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  61.36 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2720  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.054761 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  57.45 
 
 		 48 aa  56.2  0.0000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0070  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6078  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 47 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0153372  normal  0.186265 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3946  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4593  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 45 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000549229  decreased coverage  0.0000848449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 46 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486459 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4487  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849089  hitchhiker  0.00000000110171 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3321  50S ribosomal protein L34P  62.79 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9056  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00101546  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2950  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000318423  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5111  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 45 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480023  unclonable  0.0000000124693 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4172  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000696082  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3626  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118828  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0872  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4868  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 47 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000339328  hitchhiker  0.00961108 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2243  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.914999  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0092  ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0005  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000814875  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3117  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 47 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116193  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0649  50S ribosomal protein L34  54.55 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.485643  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4700  50S ribosomal protein L34P  65.12 
 
 		 45 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271583  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0553  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13959  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 47 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7341  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2827  50S ribosomal protein L34P  59.09 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0097  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4432  50S ribosomal protein L34  60 
 
 		 49 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31980  LSU ribosomal protein L34P  62.79 
 
 		 45 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23480  LSU ribosomal protein L34P  62.79 
 
 		 45 aa  54.7  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0446  50S ribosomal protein L34  61.7 
 
 		 51 aa  54.7  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1540  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000041199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0551  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2935  ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000367166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4243  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 47 aa  54.7  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0239803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7100  ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 47 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5320  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5185  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>