297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0642 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0642  50S ribosomal protein L34  100 
 
 
45 aa  88.2  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0779335  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0333  50S ribosomal protein L34  97.67 
 
 
44 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0313  50S ribosomal protein L34  95.35 
 
 
44 aa  80.5  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0872  50S ribosomal protein L34  80 
 
 
45 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2720  50S ribosomal protein L34  83.72 
 
 
44 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.054761 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1059  50S ribosomal protein L34  83.72 
 
 
44 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.202626  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0070  50S ribosomal protein L34  83.72 
 
 
44 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0081  50S ribosomal protein L34  81.4 
 
 
44 aa  70.1  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3614  50S ribosomal protein L34P  81.4 
 
 
44 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1363  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 
44 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0962  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 
44 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1021  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 
44 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.797032  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2512  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 
45 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197783  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0082  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 
44 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.376077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2353  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 
44 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1046  ribosomal protein L34  76.74 
 
 
44 aa  65.5  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0456047  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2632  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 
44 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0097  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 
44 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2310  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 
44 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0374  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 
44 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136246  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0575  50S ribosomal protein L34P  79.07 
 
 
44 aa  64.3  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2603  ribosomal protein L34  76.19 
 
 
46 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15416  normal  0.859083 
 
 
-
 
NC_002978  WD0201  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 
44 aa  62.8  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0578075  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3336  50S ribosomal protein L34P  72.09 
 
 
44 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.754449  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  75 
 
 
46 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.486459 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2138  ribosomal protein L34  72.09 
 
 
44 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1923  ribosomal protein L34  74.42 
 
 
44 aa  62  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360923  normal  0.510099 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3505  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 
44 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0561624 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0357  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 
44 aa  62  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.0448083 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 
53 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0301  ribosomal protein L34  72.09 
 
 
44 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002013  LSU ribosomal protein L34p  73.81 
 
 
44 aa  60.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000014236  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4487  ribosomal protein L34  74.42 
 
 
44 aa  61.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849089  hitchhiker  0.00000000110171 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00438  50S ribosomal protein L34  73.81 
 
 
44 aa  60.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0005  50S ribosomal protein L34  76.19 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000814875  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0583  50S ribosomal protein L34  70.73 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.0000248165  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0440  50S ribosomal protein L34  70.73 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.046605  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  72.09 
 
 
44 aa  60.5  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 
51 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  72.09 
 
 
44 aa  60.5  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2564  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
53 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0856  ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  59.7  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 
44 aa  60.1  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31980  LSU ribosomal protein L34P  71.11 
 
 
45 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27040  LSU ribosomal protein L34P  66.67 
 
 
45 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2338  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 
53 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3089  ribosomal protein L34  69.77 
 
 
44 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3321  50S ribosomal protein L34P  71.43 
 
 
44 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 
53 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916972  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  58.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3760  50S ribosomal protein L34P  73.17 
 
 
44 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  69.77 
 
 
44 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2827  50S ribosomal protein L34P  66.67 
 
 
44 aa  57.4  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 
44 aa  57.4  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2577  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  57.4  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0046  ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  57.4  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7341  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 
45 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 
52 aa  57.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4172  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 
45 aa  57  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000696082  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 
44 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23480  LSU ribosomal protein L34P  64.44 
 
 
45 aa  56.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 
44 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2088  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149936  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4548  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 
45 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0003403  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2414  ribosomal protein L34  62.79 
 
 
44 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00945499  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4138  ribosomal protein L34  60 
 
 
45 aa  55.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00368218  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1787  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0214193  normal  0.25456 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0551  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4005  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 
45 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000152105  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4383  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 
45 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4524  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 
45 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000909572  hitchhiker  0.00010277 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  65.12 
 
 
44 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4382  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 
45 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000590105  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1041  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 
44 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00984353  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0007  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 
45 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0820  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 
44 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4328  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 
45 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000182239  unclonable  0.00000000000165538 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0005  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 
45 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000407109  unclonable  0.0000000000598342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9056  ribosomal protein L34  66.67 
 
 
45 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00101546  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0984  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 
44 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0751945  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0870  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  55.1  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2243  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 
44 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.914999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3778  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 
45 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000138281  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3943  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 
45 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000682615  unclonable  0.0000000000163779 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4035  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 
45 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  unclonable  0.0000123729 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4066  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 
45 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000570066  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4513  ribosomal protein L34  64.44 
 
 
45 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334556 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3400  50S ribosomal protein L34  64.29 
 
 
44 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.812666  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3553  50S ribosomal protein L34  64.29 
 
 
44 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 
44 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0090  50S ribosomal protein L34  64.29 
 
 
44 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 
44 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4463  50S ribosomal protein L34  64.29 
 
 
44 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404373  normal  0.0831526 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3157  50S ribosomal protein L34  64.29 
 
 
44 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3101  50S ribosomal protein L34  64.29 
 
 
44 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000038228 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0012  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 
45 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000202932  hitchhiker  0.000509962 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3184  50S ribosomal protein L34  64.29 
 
 
44 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.278531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>