More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29537 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009374  OSTLU_29537  MFS family transporter: glycerol-3-phosphate  100 
 
 
494 aa  1002    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.663235  normal  0.0187062 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43611  predicted protein  27.69 
 
 
474 aa  167  5.9999999999999996e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94723  MFS family transporter: glycerol-3-phosphate  28.24 
 
 
424 aa  145  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000449836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4233  MFS family transporter  26.16 
 
 
445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3760  MFS family transporter  25.43 
 
 
447 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44190  putative sugar MFS transporter  25.7 
 
 
462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0069077  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49610  MFS family transporter  25.46 
 
 
444 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00430854  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2219  major facilitator transporter  26.44 
 
 
438 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.964638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  23.93 
 
 
449 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3680  general substrate transporter  25.51 
 
 
441 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.13 
 
 
448 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5978  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.13 
 
 
448 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03311  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.94 
 
 
455 aa  96.3  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.06 
 
 
449 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3368  major facilitator transporter  25.53 
 
 
438 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.422025 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002677  glycerol-3-phosphate transporter  25.26 
 
 
454 aa  94.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.39 
 
 
483 aa  94.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  22.66 
 
 
455 aa  94.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  22.66 
 
 
455 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  25.53 
 
 
449 aa  93.6  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2548  major facilitator transporter  25.76 
 
 
438 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0350474  decreased coverage  0.00746695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3167  major facilitator transporter  25.53 
 
 
438 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  25.71 
 
 
449 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000864698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2870  glycerol-3-phosphate transporter  22.76 
 
 
445 aa  90.5  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  25.66 
 
 
456 aa  89  2e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0729  glycerol-3-phosphate transporter  25.49 
 
 
449 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0247  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.31 
 
 
450 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0274937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0571  glycerol-3-phosphate transporter  25.49 
 
 
449 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00198632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0575  glycerol-3-phosphate transporter  25.35 
 
 
449 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3958  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.84 
 
 
449 aa  88.2  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00220837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0628  glycerol-3-phosphate transporter  25.49 
 
 
449 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000215527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0572  glycerol-3-phosphate transporter  25.49 
 
 
449 aa  88.6  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00224555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0692  glycerol-3-phosphate transporter  25.54 
 
 
449 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0661  glycerol-3-phosphate transporter  25.49 
 
 
449 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00772133  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0511  glycerol 3-phosphate transporter  22.46 
 
 
481 aa  88.2  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000061877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  25.49 
 
 
449 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170433 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0001  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.87 
 
 
452 aa  88.2  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000530916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4646  glycerol-3-phosphate transporter  25.49 
 
 
449 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000791973  unclonable  8.6547e-26 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.81 
 
 
446 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31082  MFS family transporter: glycerol-3-phosphate  22.1 
 
 
464 aa  86.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0016755  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5573  phosphoglycerate transporter family protein  27.61 
 
 
444 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2627  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.8 
 
 
452 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.588856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2523  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.8 
 
 
452 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2468  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.8 
 
 
452 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0862405 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2511  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.8 
 
 
452 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2419  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.8 
 
 
452 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5381  phosphoglycerate transporter family protein  27.61 
 
 
444 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.36 
 
 
449 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000543007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5051  phosphoglycerate transporter  25.89 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  24.36 
 
 
445 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  24.36 
 
 
445 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0225  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.87 
 
 
450 aa  84  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1436  glycerol-3-phosphate transporter, putative  23.04 
 
 
457 aa  83.6  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000217705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02166  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.31 
 
 
452 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0640  major facilitator transporter  22.5 
 
 
480 aa  83.2  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0187826  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1419  glycerol-3-phosphate transporter  22.31 
 
 
452 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  27.24 
 
 
444 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4940  glycerol-3-phosphate transporter  27.24 
 
 
444 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2622  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.31 
 
 
452 aa  82.8  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1411  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.31 
 
 
452 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  25.51 
 
 
439 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  27.24 
 
 
444 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2380  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.31 
 
 
452 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02125  hypothetical protein  22.31 
 
 
452 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2537  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.31 
 
 
452 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0206  sugar phosphate antiporter  23.68 
 
 
459 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0212  sugar phosphate antiporter  23.68 
 
 
459 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4955  glycerol-3-phosphate transporter  26.87 
 
 
444 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2392  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.31 
 
 
452 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.51 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3377  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.31 
 
 
452 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5375  phosphoglycerate transporter family protein  27.24 
 
 
444 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.07 
 
 
439 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5349  phosphoglycerate transporter family protein  26.87 
 
 
444 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  24.57 
 
 
448 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5429  phosphoglycerate transporter family protein  27.24 
 
 
444 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 
441 aa  80.5  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0029  regulatory protein UhpC  24.44 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4149  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.43 
 
 
449 aa  80.5  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000087639  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2804  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.8 
 
 
450 aa  80.1  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal  0.676266 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 
446 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5451  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.94 
 
 
449 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00923139 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.74 
 
 
451 aa  79.7  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.140488  normal  0.0295712 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  26.07 
 
 
439 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  26.07 
 
 
439 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  25.27 
 
 
446 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4175  regulatory protein UhpC  25.3 
 
 
439 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  23.82 
 
 
439 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  23.82 
 
 
439 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.113676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  24.03 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  24.03 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  24.03 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  24.03 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4014  regulatory protein UhpC  22.83 
 
 
442 aa  77.4  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4119  regulatory protein UhpC  23.34 
 
 
442 aa  77  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  24.63 
 
 
501 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3998  regulatory protein UhpC  22.54 
 
 
442 aa  77  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4177  regulatory protein UhpC  22.54 
 
 
442 aa  77  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  23.77 
 
 
439 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.47751 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  23.77 
 
 
439 aa  76.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>