32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_31082 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009358  OSTLU_31082  MFS family transporter: glycerol-3-phosphate  100 
 
 		 464 aa  933    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0016755  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29537  MFS family transporter: glycerol-3-phosphate  23.67 
 
 		 494 aa  103  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.663235  normal  0.0187062 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43611  predicted protein  23.83 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94723  MFS family transporter: glycerol-3-phosphate  22.4 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000449836 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  22.94 
 
 		 455 aa  54.7  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3760  MFS family transporter  22.1 
 
 		 447 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  22.81 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3025  major facilitator transporter  23 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  23.54 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4175  regulatory protein UhpC  23.56 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  21.34 
 
 		 445 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  21.34 
 
 		 445 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44190  putative sugar MFS transporter  22.1 
 
 		 462 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0069077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  23.31 
 
 		 439 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.113676 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3502  regulatory protein UhpC  23.45 
 
 		 447 aa  50.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  23.31 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  23.31 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0068  major facilitator transporter  22.44 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274354  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  23.31 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  23.31 
 
 		 439 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  23.31 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  23.06 
 
 		 439 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47751 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1562  major facilitator transporter  17.77 
 
 		 450 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  23.06 
 
 		 439 aa  47.4  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5461  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  26.53 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.293295 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  23.66 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4913  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  26.53 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283343  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4020  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  27.34 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  24.9 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1684  major facilitator superfamily MFS_1  21.54 
 
 		 422 aa  43.5  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.597788  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2219  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 438 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.964638 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5051  phosphoglycerate transporter  20.77 
 
 		 444 aa  43.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>