177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43611 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43611  predicted protein  100 
 
 
474 aa  958    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29537  MFS family transporter: glycerol-3-phosphate  27.69 
 
 
494 aa  154  5e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.663235  normal  0.0187062 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94723  MFS family transporter: glycerol-3-phosphate  25.29 
 
 
424 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000449836 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  26.28 
 
 
445 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  26.28 
 
 
445 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3760  MFS family transporter  25.47 
 
 
447 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44190  putative sugar MFS transporter  25.29 
 
 
462 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0069077  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  25.22 
 
 
448 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0573  glycerol-3-phosphatase transporter  24.17 
 
 
459 aa  83.6  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.167538  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4233  MFS family transporter  24.07 
 
 
445 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3259  major facilitator transporter  24.82 
 
 
431 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0867581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  27.52 
 
 
446 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0640  major facilitator transporter  25.11 
 
 
480 aa  81.3  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0187826  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0646  putative regulatory protein UhpC  26.3 
 
 
459 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3958  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.38 
 
 
449 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00220837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4149  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.71 
 
 
449 aa  78.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000087639  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  24.56 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4646  glycerol-3-phosphate transporter  26.42 
 
 
449 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000791973  unclonable  8.6547e-26 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.05 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.140488  normal  0.0295712 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  26.13 
 
 
449 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  26.22 
 
 
449 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170433 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0628  glycerol-3-phosphate transporter  25.99 
 
 
449 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000215527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0572  glycerol-3-phosphate transporter  26.22 
 
 
449 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00224555  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0661  glycerol-3-phosphate transporter  25.99 
 
 
449 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00772133  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0511  glycerol 3-phosphate transporter  24.07 
 
 
481 aa  76.3  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000061877  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.56 
 
 
483 aa  76.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0692  glycerol-3-phosphate transporter  25.75 
 
 
449 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0247  sn-glycerol-3-phosphate transporter  26.12 
 
 
450 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0274937  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.22 
 
 
449 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000543007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  25.96 
 
 
449 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000864698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0575  glycerol-3-phosphate transporter  25.92 
 
 
449 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.81 
 
 
448 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 
446 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  25.84 
 
 
449 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0571  glycerol-3-phosphate transporter  25.75 
 
 
449 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00198632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.05 
 
 
449 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0225  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.66 
 
 
450 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5978  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.58 
 
 
448 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0729  glycerol-3-phosphate transporter  25.52 
 
 
449 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2511  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.44 
 
 
452 aa  73.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2468  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.44 
 
 
452 aa  73.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0862405 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2419  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.44 
 
 
452 aa  73.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2627  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.44 
 
 
452 aa  73.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.588856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2523  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.44 
 
 
452 aa  73.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  23.6 
 
 
456 aa  73.6  0.000000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3502  regulatory protein UhpC  23.97 
 
 
447 aa  73.6  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 
441 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02166  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.22 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1419  glycerol-3-phosphate transporter  25.22 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2548  major facilitator transporter  24.31 
 
 
438 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0350474  decreased coverage  0.00746695 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1411  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.22 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2804  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.97 
 
 
450 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal  0.676266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2219  major facilitator transporter  25.81 
 
 
438 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.964638 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3167  major facilitator transporter  24.31 
 
 
438 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02125  hypothetical protein  25.22 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2380  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.22 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2537  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.22 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4175  regulatory protein UhpC  22.39 
 
 
439 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2622  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.22 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3680  general substrate transporter  24.88 
 
 
441 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3368  major facilitator transporter  24.07 
 
 
438 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.422025 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3377  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25 
 
 
452 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2392  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25 
 
 
452 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3240  putative regulatory protein UhpC  24.65 
 
 
445 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0030  sugar phosphate antiporter  24.38 
 
 
463 aa  70.5  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.668761 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  23.63 
 
 
455 aa  70.5  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  22.37 
 
 
439 aa  70.1  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03550  sugar phosphate antiporter  23.86 
 
 
463 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  22.61 
 
 
439 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  22.61 
 
 
439 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0037  phosphoglycerate transporter  23.86 
 
 
463 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  23.63 
 
 
455 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03492  hypothetical protein  23.86 
 
 
463 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4253  sugar phosphate antiporter  23.86 
 
 
463 aa  69.7  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  22.61 
 
 
439 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  23.03 
 
 
439 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.47751 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4031  sugar phosphate antiporter  23.86 
 
 
463 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.505576 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2870  glycerol-3-phosphate transporter  24.77 
 
 
445 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5096  sugar phosphate antiporter  23.86 
 
 
463 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0505973 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3879  sugar phosphate antiporter  23.86 
 
 
463 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  22.61 
 
 
439 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4174  sugar phosphate antiporter  23.86 
 
 
463 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  22.61 
 
 
439 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.113676 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  22.74 
 
 
443 aa  69.7  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  22.61 
 
 
439 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5381  phosphoglycerate transporter family protein  23.78 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03311  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.06 
 
 
455 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49610  MFS family transporter  23.84 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00430854  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2142  major facilitator superfamily transporter  24.39 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.697064  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5051  phosphoglycerate transporter  24.76 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0033  sugar phosphate antiporter  23.6 
 
 
463 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5573  phosphoglycerate transporter family protein  24.36 
 
 
444 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002677  glycerol-3-phosphate transporter  25.58 
 
 
454 aa  66.6  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0029  regulatory protein UhpC  22.56 
 
 
442 aa  66.6  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5375  phosphoglycerate transporter family protein  24.65 
 
 
444 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  24.65 
 
 
444 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  24.65 
 
 
444 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  23.49 
 
 
428 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5429  phosphoglycerate transporter family protein  24.65 
 
 
444 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  23.02 
 
 
433 aa  65.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.789702 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>