More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3240 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2682  major facilitator transporter  76.14 
 
 		 447 aa  685    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.874415  normal  0.720259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2750  major facilitator transporter  76.36 
 
 		 447 aa  686    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0646  putative regulatory protein UhpC  76.35 
 
 		 459 aa  717    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3240  putative regulatory protein UhpC  100 
 
 		 445 aa  901    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4119  regulatory protein UhpC  31.65 
 
 		 442 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3998  regulatory protein UhpC  31.65 
 
 		 442 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4177  regulatory protein UhpC  31.65 
 
 		 442 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  33.25 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4175  regulatory protein UhpC  33 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  33.25 
 
 		 439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4014  regulatory protein UhpC  31.41 
 
 		 442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  33 
 
 		 439 aa  217  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  33 
 
 		 439 aa  217  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.113676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  33 
 
 		 439 aa  216  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  33 
 
 		 439 aa  216  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  33 
 
 		 439 aa  216  7e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  33 
 
 		 439 aa  216  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4069  regulatory protein UhpC  30.94 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0029  regulatory protein UhpC  30.77 
 
 		 442 aa  213  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  30.12 
 
 		 443 aa  207  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5451  sn-glycerol-3-phosphate transporter  33.33 
 
 		 449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00923139 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4130  regulatory protein UhpC  29.13 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.543128  normal  0.246836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.45 
 
 		 446 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  30.75 
 
 		 446 aa  196  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4078  regulatory protein UhpC  28.88 
 
 		 443 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2060  glycerol-3-phosphate transporter  31.52 
 
 		 452 aa  196  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3502  regulatory protein UhpC  29.65 
 
 		 447 aa  195  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0083  regulatory protein UhpC  28.88 
 
 		 443 aa  195  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644662  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0395  glycerol-3-phosphate transporter  34.63 
 
 		 452 aa  192  9e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0536129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0385  glycerol-3-phosphate transporter  34.63 
 
 		 452 aa  192  9e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000112087  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  32.6 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  32.68 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  33.76 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.83 
 
 		 448 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0511  glycerol 3-phosphate transporter  30.43 
 
 		 481 aa  190  5e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000061877  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2870  glycerol-3-phosphate transporter  34.65 
 
 		 445 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  29.18 
 
 		 456 aa  187  2e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0572  glycerol-3-phosphate transporter  32.59 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00224555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  32.59 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170433 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3958  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.03 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00220837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0628  glycerol-3-phosphate transporter  32.35 
 
 		 449 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000215527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0661  glycerol-3-phosphate transporter  32.35 
 
 		 449 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00772133  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  30.56 
 
 		 445 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  30.56 
 
 		 445 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0729  glycerol-3-phosphate transporter  31.68 
 
 		 449 aa  186  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0692  glycerol-3-phosphate transporter  32.15 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0571  glycerol-3-phosphate transporter  31.27 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00198632  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5978  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.35 
 
 		 448 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  31.27 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000864698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4646  glycerol-3-phosphate transporter  33 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000791973  unclonable  8.6547e-26 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1419  glycerol-3-phosphate transporter  31.67 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1411  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.67 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.476503 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02166  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.67 
 
 		 452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2537  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.67 
 
 		 452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3377  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.67 
 
 		 452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2392  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.67 
 
 		 452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2622  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.67 
 
 		 452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02125  hypothetical protein  31.67 
 
 		 452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2380  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.67 
 
 		 452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2804  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.5 
 
 		 450 aa  184  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal  0.676266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2523  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.67 
 
 		 452 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  30.18 
 
 		 483 aa  183  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2511  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.67 
 
 		 452 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0247  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.67 
 
 		 450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0274937  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2419  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.67 
 
 		 452 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2627  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.67 
 
 		 452 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588856 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2468  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.67 
 
 		 452 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0862405 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.5 
 
 		 449 aa  182  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000543007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  31.6 
 
 		 449 aa  182  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4149  sn-glycerol-3-phosphate transporter  30.31 
 
 		 449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000087639  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0575  glycerol-3-phosphate transporter  30.95 
 
 		 449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  32.14 
 
 		 451 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.140488  normal  0.0295712 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0225  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.74 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3790  phosphoglycerate transporter  30.36 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5051  phosphoglycerate transporter  30.08 
 
 		 444 aa  177  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4940  glycerol-3-phosphate transporter  30.33 
 
 		 444 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03311  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.07 
 
 		 455 aa  176  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  30.33 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  31.09 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  30.59 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  30.33 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5381  phosphoglycerate transporter family protein  30.08 
 
 		 444 aa  173  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5349  phosphoglycerate transporter family protein  30.08 
 
 		 444 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4955  glycerol-3-phosphate transporter  30.08 
 
 		 444 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5573  phosphoglycerate transporter family protein  29.82 
 
 		 444 aa  172  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5429  phosphoglycerate transporter family protein  29.82 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5375  phosphoglycerate transporter family protein  29.82 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002677  glycerol-3-phosphate transporter  30.34 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0640  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 480 aa  171  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0187826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0001  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.67 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000530916  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  31.93 
 
 		 457 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2547  regulatory protein UhpC  30.3 
 
 		 440 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0466951 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2344  regulatory protein UhpC  30.3 
 
 		 440 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.209168  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2389  regulatory protein UhpC  30.3 
 
 		 440 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.365654 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2433  regulatory protein UhpC  30.3 
 
 		 440 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.186527 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2437  regulatory protein UhpC  30.3 
 
 		 440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1684  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 422 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.597788  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.789702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>