17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0474 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0474  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D-proline reductase family  100 
 
 		 435 aa  883    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1136  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D- proline reductase family  61.84 
 
 		 436 aa  568  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2119  glycine reductase complex selenoprotein GrdB2  61.43 
 
 		 431 aa  550  1e-155  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25230  glycine reductase, selenoprotein B  59.35 
 
 		 437 aa  520  1e-146  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00287669  normal  0.0219994 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0113  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D-proline reductase family  56.91 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21500  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D-proline reductase family  52.3 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.206379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2725  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D- proline reductase family  60.34 
 
 		 345 aa  432  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25400  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D-proline reductase family  48.75 
 
 		 442 aa  428  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000639897  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0078  glycine reductase complex selenoprotein GrdB1  43.68 
 
 		 443 aa  375  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2726  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D- proline reductase family  68.83 
 
 		 77 aa  113  8.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1982  hypothetical protein  29.5 
 
 		 160 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.0360501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2192  putative reductase  28.49 
 
 		 211 aa  50.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.181535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4763  hypothetical protein  23.24 
 
 		 308 aa  50.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2712  Glycine/sarcosine/betaine reductase complex protein B alpha and beta subunits  30.83 
 
 		 552 aa  49.7  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.640748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1432  glycine/sarcosine/betaine reductase selenoprotein B  25.42 
 
 		 174 aa  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000666496  normal  0.211393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3052  hypothetical protein  23.01 
 
 		 310 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3322  hypothetical protein  22.12 
 
 		 311 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>