14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3322 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3322  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3052  hypothetical protein  81.67 
 
 		 310 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4763  hypothetical protein  75.32 
 
 		 308 aa  491  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2192  putative reductase  34.52 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.181535  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0209  hypothetical protein  42.42 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1982  hypothetical protein  38 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.0360501 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4405  putative reductase  36.36 
 
 		 102 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1149  hypothetical protein  31.43 
 
 		 145 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1279  hypothetical protein  30.71 
 
 		 145 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1209  hypothetical protein  30.71 
 
 		 145 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0388177  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4406  hypothetical protein  32.14 
 
 		 169 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1196  hypothetical protein  28.68 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0474  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D-proline reductase family  22.12 
 
 		 435 aa  43.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0950  hypothetical protein  34.35 
 
 		 153 aa  42.7  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0446042  hitchhiker  0.00000586198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>