20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2192 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2192  putative reductase  100 
 
 		 211 aa  417  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.181535  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0093  hypothetical protein  47.45 
 
 		 170 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1982  hypothetical protein  42.11 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.0360501 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4406  hypothetical protein  37.78 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3322  hypothetical protein  34.52 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4763  hypothetical protein  34.65 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3052  hypothetical protein  33.01 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1149  hypothetical protein  40.46 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1279  hypothetical protein  40.91 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1209  hypothetical protein  40.91 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0388177  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1196  hypothetical protein  38.64 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2712  Glycine/sarcosine/betaine reductase complex protein B alpha and beta subunits  33.87 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.640748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25230  glycine reductase, selenoprotein B  30.73 
 
 		 437 aa  58.5  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00287669  normal  0.0219994 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0950  hypothetical protein  37.01 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0446042  hitchhiker  0.00000586198 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0078  glycine reductase complex selenoprotein GrdB1  25 
 
 		 443 aa  52.4  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0474  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D-proline reductase family  28.04 
 
 		 435 aa  50.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1136  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D- proline reductase family  28.1 
 
 		 436 aa  49.7  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2119  glycine reductase complex selenoprotein GrdB2  27.57 
 
 		 431 aa  48.5  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2725  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D- proline reductase family  29.01 
 
 		 345 aa  46.2  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0113  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D-proline reductase family  26.07 
 
 		 434 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>