16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3052 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3052  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  634    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3322  hypothetical protein  81.67 
 
 		 311 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4763  hypothetical protein  75.59 
 
 		 308 aa  478  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2192  putative reductase  33.01 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.181535  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0209  hypothetical protein  49.25 
 
 		 66 aa  68.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1982  hypothetical protein  38.1 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.0360501 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4405  putative reductase  35.23 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0950  hypothetical protein  38.17 
 
 		 153 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0446042  hitchhiker  0.00000586198 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0474  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D-proline reductase family  23.01 
 
 		 435 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0078  glycine reductase complex selenoprotein GrdB1  25.12 
 
 		 443 aa  46.6  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25230  glycine reductase, selenoprotein B  27.27 
 
 		 437 aa  46.2  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00287669  normal  0.0219994 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0113  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D-proline reductase family  24.31 
 
 		 434 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1279  hypothetical protein  28.12 
 
 		 145 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4406  hypothetical protein  32.14 
 
 		 169 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1209  hypothetical protein  28.12 
 
 		 145 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0388177  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1149  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>