22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1982 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1982  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  318  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.0360501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2192  putative reductase  42.11 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.181535  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0950  hypothetical protein  44.44 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0446042  hitchhiker  0.00000586198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4406  hypothetical protein  36.3 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0093  hypothetical protein  35.92 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1279  hypothetical protein  39.02 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1209  hypothetical protein  39.02 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0388177  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1149  hypothetical protein  38.21 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2712  Glycine/sarcosine/betaine reductase complex protein B alpha and beta subunits  33.83 
 
 		 552 aa  64.3  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.640748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3052  hypothetical protein  38.1 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3322  hypothetical protein  38 
 
 		 311 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4763  hypothetical protein  36 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2119  glycine reductase complex selenoprotein GrdB2  31.06 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1196  hypothetical protein  34.96 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1136  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D- proline reductase family  26.97 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2725  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D- proline reductase family  30.08 
 
 		 345 aa  54.3  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0474  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D-proline reductase family  29.5 
 
 		 435 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25230  glycine reductase, selenoprotein B  30 
 
 		 437 aa  50.4  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00287669  normal  0.0219994 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0078  glycine reductase complex selenoprotein GrdB1  28.35 
 
 		 443 aa  50.4  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0113  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D-proline reductase family  29.09 
 
 		 434 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25400  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D-proline reductase family  27.61 
 
 		 442 aa  45.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000639897  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21500  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D-proline reductase family  35.29 
 
 		 431 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.206379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>