27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2712 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2712  Glycine/sarcosine/betaine reductase complex protein B alpha and beta subunits  100 
 
 		 552 aa  1140    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.640748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0093  hypothetical protein  39.23 
 
 		 170 aa  98.2  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1196  hypothetical protein  37.19 
 
 		 144 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1279  hypothetical protein  34.71 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1209  hypothetical protein  34.71 
 
 		 145 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0388177  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1149  hypothetical protein  33.88 
 
 		 145 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4406  hypothetical protein  33.59 
 
 		 169 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2192  putative reductase  33.87 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.181535  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1982  hypothetical protein  33.83 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.0360501 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0472  Sarcosine reductase  26.14 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0950  hypothetical protein  34.19 
 
 		 153 aa  68.6  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0446042  hitchhiker  0.00000586198 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2722  Glycine/sarcosine/betaine reductase complex protein B alpha and beta subunits  23.32 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.38212  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1043  Sarcosine reductase  22.31 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.317745 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2120  glycine reductase complex proprotein GrdE2  29.41 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000888555  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0112  Sarcosine reductase  22.02 
 
 		 428 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.894091  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1136  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D- proline reductase family  32.14 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1138  Glycine/sarcosine/betaine reductase complex protein B alpha and beta subunits  25.77 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0077  glycine reductase complex proprotein GrdE1  29.56 
 
 		 436 aa  60.1  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0078  glycine reductase complex selenoprotein GrdB1  28.49 
 
 		 443 aa  56.2  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2725  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D- proline reductase family  30 
 
 		 345 aa  54.7  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21510  glycine/sarcosine/betaine reductase component B alpha/beta subunit  27.27 
 
 		 427 aa  53.5  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.133637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21500  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D-proline reductase family  31.29 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.206379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0474  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D-proline reductase family  30.83 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0113  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D-proline reductase family  28.92 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25240  glycine/sarcosine/betaine reductase component B alpha/beta subunit  23.78 
 
 		 426 aa  48.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.020475  normal  0.0446694 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2119  glycine reductase complex selenoprotein GrdB2  30.4 
 
 		 431 aa  48.1  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25410  glycine/sarcosine/betaine reductase component B alpha/beta subunit  27.66 
 
 		 442 aa  47.8  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000707635  normal  0.515171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>