17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4763 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4763  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  632  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3322  hypothetical protein  75.32 
 
 
311 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3052  hypothetical protein  75.59 
 
 
310 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2192  putative reductase  34.65 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.181535  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0209  hypothetical protein  48.39 
 
 
66 aa  75.5  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1982  hypothetical protein  36 
 
 
160 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.0360501 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0078  glycine reductase complex selenoprotein GrdB1  27.6 
 
 
443 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4405  putative reductase  32.53 
 
 
102 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0474  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D-proline reductase family  23.24 
 
 
435 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2119  glycine reductase complex selenoprotein GrdB2  25.84 
 
 
431 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21500  selenoprotein B, glycine/betaine/sarcosine/D-proline reductase family  26.38 
 
 
431 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.206379  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25230  glycine reductase, selenoprotein B  25.12 
 
 
437 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00287669  normal  0.0219994 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0950  hypothetical protein  35.88 
 
 
153 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0446042  hitchhiker  0.00000586198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4406  hypothetical protein  30 
 
 
169 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1209  hypothetical protein  29.23 
 
 
145 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0388177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1279  hypothetical protein  29.23 
 
 
145 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1196  hypothetical protein  26.57 
 
 
144 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>