76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3453 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3453  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454746  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2462  hypothetical protein  57.87 
 
 		 241 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5482  hypothetical protein  59 
 
 		 254 aa  245  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1545  hypothetical protein  58.87 
 
 		 271 aa  238  8e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120558  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3382  Protein of unknown function DUF2344  56.3 
 
 		 293 aa  237  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7273  hypothetical protein  58.05 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0754  hypothetical protein  57.94 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2184  hypothetical protein  55.02 
 
 		 288 aa  218  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801459  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3862  hypothetical protein  59.09 
 
 		 231 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.915383  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1586  Protein of unknown function DUF2344  58.15 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7274  hypothetical protein  53.67 
 
 		 290 aa  204  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1185  hypothetical protein  49.79 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1217  hypothetical protein  53.39 
 
 		 249 aa  202  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5263  hypothetical protein  50.46 
 
 		 253 aa  189  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3483  hypothetical protein  55.5 
 
 		 208 aa  172  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4340  radical sam protein, putative  36.82 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.144129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3327  hypothetical protein  35 
 
 		 232 aa  111  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2537  hypothetical protein  32.16 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000108201  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2122  hypothetical protein  30.49 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0089557  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  34.83 
 
 		 842 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  35.2 
 
 		 812 aa  101  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  35.39 
 
 		 826 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  34.74 
 
 		 828 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  34.21 
 
 		 828 aa  99.8  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.06 
 
 		 887 aa  99.8  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  36.53 
 
 		 828 aa  99.8  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0555  hypothetical protein  35.38 
 
 		 221 aa  98.6  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1206  hypothetical protein  32.22 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  33.84 
 
 		 842 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0670  hypothetical protein  31.13 
 
 		 898 aa  94.4  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1424  hypothetical protein  31.65 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.160041  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0877  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.27 
 
 		 872 aa  92  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856877 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  31.43 
 
 		 882 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1232  hypothetical protein  30.67 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1945  Protein of unknown function DUF2344  31.19 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1318  hypothetical protein  25.99 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.452559  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1454  hypothetical protein  36.5 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.179881  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  41.75 
 
 		 836 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.51 
 
 		 894 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0157  hypothetical protein  27.54 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  38.46 
 
 		 910 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  43.22 
 
 		 898 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  32.95 
 
 		 852 aa  79  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  41.07 
 
 		 898 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  39.6 
 
 		 817 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  41.07 
 
 		 898 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2099  hypothetical protein  30.23 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0295981  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  25.58 
 
 		 860 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2387  hypothetical protein  29.65 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1644  radical SAM domain-containing protein  35.75 
 
 		 864 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2192  Protein of unknown function DUF2344  33.56 
 
 		 842 aa  73.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1615  hypothetical protein  30.85 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  27.68 
 
 		 856 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 		 857 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  27.32 
 
 		 879 aa  72  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  32.97 
 
 		 897 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14140  hypothetical protein  33.7 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000415574  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  30.52 
 
 		 874 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2564  hypothetical protein  21.67 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0239  Beta tubulin, autoregulation binding site  36.77 
 
 		 897 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0547979 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14170  uncharacterized conserved protein (DUF2344)  38.2 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0677  hypothetical protein  32.31 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000513675  normal  0.22749 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06140  uncharacterized conserved protein (DUF2344)  38.64 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750294 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.95 
 
 		 860 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  38.46 
 
 		 849 aa  65.9  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1264  radical SAM family protein  41.67 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000122939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2130  hypothetical protein  34.57 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1025  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 922 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1232  radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0526  hypothetical protein  30.3 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.002712  normal  0.0179018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3784  Protein of unknown function DUF2344  33.53 
 
 		 971 aa  55.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539179  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0451  hypothetical protein  25.44 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0510927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0466  uncharacterized protein-like protein  25.44 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0842  hypothetical protein  27.34 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0091  uncharacterized protein-like protein  27.62 
 
 		 195 aa  52.8  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1201  hypothetical protein  29.85 
 
 		 212 aa  46.2  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>