64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3483 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3483  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  408  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3862  hypothetical protein  90.34 
 
 		 231 aa  344  6e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.915383  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1185  hypothetical protein  58.05 
 
 		 246 aa  226  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7273  hypothetical protein  57.35 
 
 		 259 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5482  hypothetical protein  60.78 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1545  hypothetical protein  60.19 
 
 		 271 aa  210  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120558  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2462  hypothetical protein  55.39 
 
 		 241 aa  207  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1217  hypothetical protein  54.19 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3382  Protein of unknown function DUF2344  56.16 
 
 		 293 aa  194  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3453  hypothetical protein  55.5 
 
 		 236 aa  185  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454746  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5263  hypothetical protein  50.74 
 
 		 253 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0754  hypothetical protein  56.22 
 
 		 268 aa  181  7e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1586  Protein of unknown function DUF2344  59.41 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2184  hypothetical protein  52.38 
 
 		 288 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7274  hypothetical protein  51.49 
 
 		 290 aa  174  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2122  hypothetical protein  29.23 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0089557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0555  hypothetical protein  31.55 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3327  hypothetical protein  31.79 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  37.29 
 
 		 828 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  35.94 
 
 		 842 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  34.71 
 
 		 836 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  36 
 
 		 842 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 828 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2537  hypothetical protein  30.46 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000108201  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 828 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 826 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1025  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 		 922 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  37.27 
 
 		 898 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  37.27 
 
 		 898 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4340  radical sam protein, putative  29.33 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.144129  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  37.27 
 
 		 898 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.03 
 
 		 860 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.49 
 
 		 887 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0157  hypothetical protein  25.93 
 
 		 279 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 812 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0670  hypothetical protein  27.47 
 
 		 898 aa  55.8  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1454  hypothetical protein  30.77 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.179881  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0239  Beta tubulin, autoregulation binding site  33.75 
 
 		 897 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0547979 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14140  hypothetical protein  30.12 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000415574  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1206  hypothetical protein  28.46 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1424  hypothetical protein  26.15 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.160041  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2387  hypothetical protein  24.66 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1945  Protein of unknown function DUF2344  27.27 
 
 		 229 aa  52.4  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1644  radical SAM domain-containing protein  32.77 
 
 		 864 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0877  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.93 
 
 		 872 aa  52.4  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856877 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2099  hypothetical protein  23.97 
 
 		 235 aa  51.6  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0295981  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0677  hypothetical protein  31.9 
 
 		 270 aa  52  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000513675  normal  0.22749 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1232  hypothetical protein  23.61 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1318  hypothetical protein  26.52 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.452559  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  33.03 
 
 		 897 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  26.26 
 
 		 879 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2192  Protein of unknown function DUF2344  26.26 
 
 		 842 aa  48.9  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  38.98 
 
 		 817 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.79 
 
 		 894 aa  46.6  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  24.48 
 
 		 882 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  31.3 
 
 		 852 aa  46.2  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2564  hypothetical protein  22.92 
 
 		 290 aa  45.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14170  uncharacterized conserved protein (DUF2344)  41.18 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2130  hypothetical protein  29.33 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1232  radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1615  hypothetical protein  32.05 
 
 		 254 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  31.65 
 
 		 910 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06140  uncharacterized conserved protein (DUF2344)  36.84 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750294 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0091  uncharacterized protein-like protein  23.44 
 
 		 195 aa  41.6  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>