58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0091 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0091  uncharacterized protein-like protein  100 
 
 
195 aa  395  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0842  hypothetical protein  33.16 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0466  uncharacterized protein-like protein  35.2 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0451  hypothetical protein  34.69 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0510927  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1185  hypothetical protein  34.02 
 
 
246 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5482  hypothetical protein  26.61 
 
 
254 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276592  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  32.14 
 
 
826 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1217  hypothetical protein  36.63 
 
 
249 aa  62  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  34.09 
 
 
842 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  34.69 
 
 
828 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  31.3 
 
 
842 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1545  hypothetical protein  30.11 
 
 
271 aa  58.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120558  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2462  hypothetical protein  22.22 
 
 
241 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  31.09 
 
 
898 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  31.09 
 
 
898 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  32.63 
 
 
828 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  34.07 
 
 
898 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5263  hypothetical protein  30 
 
 
253 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14140  hypothetical protein  30.71 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000415574  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1025  Radical SAM domain protein  34.09 
 
 
922 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0526  hypothetical protein  31.37 
 
 
238 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.002712  normal  0.0179018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1586  Protein of unknown function DUF2344  30.68 
 
 
255 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2537  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000108201  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1644  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 
864 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  30.11 
 
 
828 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7274  hypothetical protein  31.63 
 
 
290 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0239  Beta tubulin, autoregulation binding site  29.7 
 
 
897 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0547979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7273  hypothetical protein  23.49 
 
 
259 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3453  hypothetical protein  27.62 
 
 
236 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454746  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.91 
 
 
860 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3382  Protein of unknown function DUF2344  26 
 
 
293 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  30.68 
 
 
812 aa  51.6  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  32.58 
 
 
836 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2192  Protein of unknown function DUF2344  30.43 
 
 
842 aa  50.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3327  hypothetical protein  28.42 
 
 
232 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0754  hypothetical protein  33.33 
 
 
268 aa  50.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  30.61 
 
 
849 aa  48.5  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2122  hypothetical protein  28.85 
 
 
217 aa  48.5  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0089557  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 
852 aa  48.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 
897 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0555  hypothetical protein  26.77 
 
 
221 aa  47.8  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3862  hypothetical protein  42.22 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.915383  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  29.03 
 
 
882 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2184  hypothetical protein  25.81 
 
 
288 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801459  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  40.74 
 
 
817 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  22.66 
 
 
910 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 
860 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1639  Radical SAM domain protein  32.04 
 
 
803 aa  45.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1454  hypothetical protein  29.03 
 
 
224 aa  44.7  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.179881  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2130  hypothetical protein  25.83 
 
 
211 aa  43.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4340  radical sam protein, putative  21.55 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.144129  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.74 
 
 
894 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1264  radical SAM family protein  27.52 
 
 
215 aa  42.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000122939  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.71 
 
 
887 aa  42.4  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1424  hypothetical protein  27.5 
 
 
214 aa  42  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.160041  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1945  Protein of unknown function DUF2344  25.89 
 
 
229 aa  42.4  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1232  hypothetical protein  25.41 
 
 
214 aa  42  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1201  hypothetical protein  24.74 
 
 
212 aa  41.2  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>