More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1629 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1629  amidohydrolase  100 
 
 
474 aa  933    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1957  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  42.7 
 
 
441 aa  296  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.157555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3012  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  37.64 
 
 
442 aa  277  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1672  selenium metabolism protein SsnA  36.36 
 
 
442 aa  277  4e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4169  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  37.41 
 
 
442 aa  276  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1737  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  36 
 
 
443 aa  276  7e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02712  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  37.41 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0813  selenium metabolism protein SsnA  37.41 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3205  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  37.41 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02674  hypothetical protein  37.41 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3039  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  37.41 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0829  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  37.41 
 
 
442 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1427  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  36.8 
 
 
439 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0458985  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0236  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  36.01 
 
 
451 aa  260  4e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2655  selenium metabolism protein SsnA  34.6 
 
 
443 aa  252  8.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0422  selenium metabolism protein SsnA  37.42 
 
 
450 aa  248  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1494  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  32.11 
 
 
445 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0120  amidohydrolase  30.43 
 
 
426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3416  amidohydrolase  39.12 
 
 
378 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.729562  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3952  amidohydrolase  29.11 
 
 
422 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  27.95 
 
 
434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.76 
 
 
440 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  29.48 
 
 
430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.05 
 
 
432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  28.05 
 
 
431 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  23.67 
 
 
431 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  28.15 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  28.5 
 
 
428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  24.46 
 
 
422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  27.64 
 
 
445 aa  117  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.76 
 
 
484 aa  117  6e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.75 
 
 
451 aa  117  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  25.73 
 
 
398 aa  116  7.999999999999999e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  27.32 
 
 
431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0059  amidohydrolase  27.83 
 
 
448 aa  113  6e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.312881  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  24.94 
 
 
422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  29.05 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  24.1 
 
 
434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  24.46 
 
 
422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  29.37 
 
 
413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1915  amidohydrolase  28.46 
 
 
421 aa  110  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232567  normal  0.102109 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  25.2 
 
 
431 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  23.18 
 
 
420 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  29.49 
 
 
447 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  29.03 
 
 
440 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1029  amidohydrolase  26.47 
 
 
438 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.951911  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.7 
 
 
455 aa  106  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4342  amidohydrolase  28.81 
 
 
483 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295649  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  26.91 
 
 
442 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.38 
 
 
441 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  23.13 
 
 
428 aa  104  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  25.57 
 
 
433 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.96 
 
 
442 aa  104  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  24.94 
 
 
422 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0768  amidohydrolase  27.06 
 
 
442 aa  103  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0368346  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  27.63 
 
 
432 aa  103  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  26.23 
 
 
435 aa  103  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  26.23 
 
 
435 aa  103  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.97 
 
 
459 aa  103  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  23.45 
 
 
434 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  25.35 
 
 
435 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  25.35 
 
 
435 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  25.35 
 
 
435 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0728  putative hydrolase  26.73 
 
 
443 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951469  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1087  amidohydrolase  27.27 
 
 
435 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0252  amidohydrolase  26.05 
 
 
427 aa  101  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.99632  normal  0.114468 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  24.28 
 
 
431 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4530  amidohydrolase  28.14 
 
 
488 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3147  amidohydrolase  32.65 
 
 
474 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171456  normal  0.0352292 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0482  amidohydrolase  26.13 
 
 
416 aa  100  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  25.76 
 
 
435 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.76 
 
 
444 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  24.88 
 
 
435 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  26.05 
 
 
435 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  24.82 
 
 
432 aa  99.8  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  22.76 
 
 
436 aa  99.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  25.41 
 
 
435 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  25.46 
 
 
435 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  25.58 
 
 
663 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  25.58 
 
 
441 aa  97.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  26.79 
 
 
426 aa  97.1  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.52 
 
 
441 aa  97.1  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.13 
 
 
445 aa  96.7  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  27.36 
 
 
656 aa  97.1  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3129  amidohydrolase  26.11 
 
 
434 aa  96.7  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.611034  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  29.5 
 
 
451 aa  96.7  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1737  amidohydrolase  23.83 
 
 
411 aa  95.9  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1851  amidohydrolase  27.36 
 
 
432 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0758  amidohydrolase  24.61 
 
 
442 aa  95.1  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.54 
 
 
449 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2080  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.4 
 
 
436 aa  95.5  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  29.67 
 
 
461 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.54 
 
 
449 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.6 
 
 
444 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  29.07 
 
 
440 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  27.34 
 
 
429 aa  94  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  26.36 
 
 
442 aa  94  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  24.87 
 
 
426 aa  93.6  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  25.27 
 
 
663 aa  94  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3159  amidohydrolase  29.69 
 
 
447 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0462314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>