84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1628 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1628  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 723 aa  1467    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1241  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  24.93 
 
 		 768 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1227  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  25.08 
 
 		 791 aa  134  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.25361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0728  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  24.88 
 
 		 791 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1471  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  25.42 
 
 		 791 aa  132  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0823956  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1041  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  28.73 
 
 		 1225 aa  114  9e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.588089  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0633  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  22.26 
 
 		 709 aa  94.4  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0332169  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1264  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  31.95 
 
 		 757 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0009  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  36.36 
 
 		 730 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0630863 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.98 
 
 		 695 aa  82.4  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2811  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic  34.42 
 
 		 732 aa  80.5  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.140611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2125  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic  33.12 
 
 		 795 aa  79.3  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1190  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  28.11 
 
 		 690 aa  75.5  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.629609 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1037  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  32.03 
 
 		 794 aa  73.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0320  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  35.06 
 
 		 731 aa  72.8  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.706326  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1709  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  32.24 
 
 		 729 aa  70.9  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.37084  normal  0.962823 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2622  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  21.19 
 
 		 719 aa  70.5  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1698  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  26.64 
 
 		 627 aa  68.2  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0513  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  22.85 
 
 		 623 aa  67.4  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  19.35 
 
 		 670 aa  66.2  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00598152  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1191  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  20.5 
 
 		 730 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112053 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0306  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  42.71 
 
 		 656 aa  61.2  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.674965  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1995  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  21.64 
 
 		 709 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0898162  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0068  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25 
 
 		 697 aa  60.1  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0892  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.55 
 
 		 695 aa  59.3  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0982994  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0445  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  21.82 
 
 		 706 aa  58.9  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1057  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25.45 
 
 		 721 aa  58.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0906  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  21.17 
 
 		 715 aa  57.4  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11050  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.88 
 
 		 676 aa  56.2  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.177908  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4798  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  21.15 
 
 		 712 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4734  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  21.15 
 
 		 712 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.715295  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4832  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  21.15 
 
 		 712 aa  55.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4853  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  21.15 
 
 		 712 aa  55.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4703  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  21.15 
 
 		 712 aa  55.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4846  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  21.11 
 
 		 712 aa  54.7  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758929  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1601  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25 
 
 		 706 aa  54.7  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0646  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.76 
 
 		 696 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132822  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1071  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  24.32 
 
 		 1197 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00208711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2681  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25 
 
 		 681 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2140  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic  25.28 
 
 		 604 aa  53.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1317  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.46 
 
 		 744 aa  53.1  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3773  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  21.11 
 
 		 712 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5758  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  20.93 
 
 		 712 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04070  hypothetical protein  20.93 
 
 		 712 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4718  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  20.93 
 
 		 712 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3756  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  20.93 
 
 		 712 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04106  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  20.93 
 
 		 712 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1124  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.54 
 
 		 701 aa  52.4  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4492  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  20.93 
 
 		 712 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0693  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  22.7 
 
 		 676 aa  52  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4809  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  20.75 
 
 		 712 aa  52  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1144  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.87 
 
 		 692 aa  51.6  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0333221  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2570  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  26.54 
 
 		 730 aa  50.8  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.980594  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0277  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.06 
 
 		 638 aa  50.8  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0226  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  21.77 
 
 		 606 aa  50.4  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00295512  normal  0.636245 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1331  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25.84 
 
 		 708 aa  50.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0843156  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0978  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.91 
 
 		 630 aa  50.4  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0378  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  21.77 
 
 		 606 aa  50.4  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.73925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3050  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.02 
 
 		 708 aa  50.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18290  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.89 
 
 		 816 aa  48.9  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0421  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.15 
 
 		 689 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1116  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  26.45 
 
 		 733 aa  48.5  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.287436  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0138  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.39 
 
 		 738 aa  48.1  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.450422 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3397  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  22.56 
 
 		 686 aa  48.1  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0791  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  21.33 
 
 		 706 aa  47.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0740  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  20.14 
 
 		 704 aa  47  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0021  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  28.75 
 
 		 689 aa  47  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1401  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.51 
 
 		 710 aa  47.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00712493  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1233  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  21.72 
 
 		 704 aa  47.4  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2730  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  28.85 
 
 		 813 aa  47  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.453605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1449  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.61 
 
 		 705 aa  46.2  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.437594 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2834  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  20.87 
 
 		 705 aa  46.2  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1819  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.48 
 
 		 636 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2273  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.19 
 
 		 718 aa  45.8  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.414975  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1054  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.71 
 
 		 746 aa  45.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0535  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  20.23 
 
 		 800 aa  45.8  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000021031  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0360  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  20.94 
 
 		 712 aa  45.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3691  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  19.68 
 
 		 712 aa  45.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693089  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2086  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25.88 
 
 		 723 aa  45.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4035  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  19.68 
 
 		 712 aa  45.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0277  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  20.09 
 
 		 747 aa  45.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3556  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  19.68 
 
 		 712 aa  45.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3517  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.36 
 
 		 673 aa  44.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0426  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  28.12 
 
 		 893 aa  44.7  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>