280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_11050 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3580  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.75 
 
 		 683 aa  714    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4657  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.75 
 
 		 683 aa  714    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.68774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2718  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.17 
 
 		 591 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.529352  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1331  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.51 
 
 		 708 aa  738    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0843156  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0535  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.46 
 
 		 800 aa  698    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000021031  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0068  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.22 
 
 		 697 aa  665    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0963  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.25 
 
 		 683 aa  726    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.391943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2642  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.35 
 
 		 673 aa  738    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2106  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.16 
 
 		 687 aa  729    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.849515  normal  0.994993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0646  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  58.9 
 
 		 696 aa  830    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132822  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0906  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  60.45 
 
 		 715 aa  872    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0629  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.94 
 
 		 583 aa  644    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00137002  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3365  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.72 
 
 		 675 aa  694    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172417  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1779  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.49 
 
 		 669 aa  715    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0307976  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2171  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.47 
 
 		 676 aa  708    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00664522  hitchhiker  0.00155539 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2809  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.94 
 
 		 583 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0106  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50 
 
 		 675 aa  701    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2685  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.94 
 
 		 583 aa  644    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2742  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.94 
 
 		 583 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450074  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0277  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.12 
 
 		 638 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3016  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.67 
 
 		 685 aa  687    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1401  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.7 
 
 		 710 aa  656    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00712493  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1276  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.22 
 
 		 673 aa  730    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1449  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  63.4 
 
 		 705 aa  905    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.437594 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2340  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.17 
 
 		 591 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.855235  normal  0.0211703 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1809  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.94 
 
 		 596 aa  645    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0368  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.42 
 
 		 675 aa  698    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2904  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.94 
 
 		 587 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818953  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3517  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.14 
 
 		 673 aa  722    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3397  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.9 
 
 		 686 aa  687    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1819  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.06 
 
 		 636 aa  640    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1995  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  56.74 
 
 		 709 aa  813    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0898162  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1698  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  59.83 
 
 		 627 aa  750    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5139  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.05 
 
 		 574 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.766107  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0892  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  56.76 
 
 		 695 aa  773    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0982994  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1057  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  60.21 
 
 		 721 aa  868    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0454  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.74 
 
 		 703 aa  648    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000238531  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2273  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  64.77 
 
 		 718 aa  918    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.414975  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0305  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.17 
 
 		 629 aa  641    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113243 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2730  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.57 
 
 		 813 aa  695    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.453605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39690  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.72 
 
 		 675 aa  711    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.192369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1601  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  56.1 
 
 		 706 aa  801    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  67.32 
 
 		 695 aa  966    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1473  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.25 
 
 		 704 aa  676    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2768  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  54.42 
 
 		 608 aa  661    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.722905  hitchhiker  0.0000187982 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1698  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.94 
 
 		 583 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2622  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  61.42 
 
 		 719 aa  876    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2989  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.32 
 
 		 581 aa  642    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.935687  normal  0.463856 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11050  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  100 
 
 		 676 aa  1412    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.177908  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2570  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  64.07 
 
 		 730 aa  915    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.980594  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1144  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  68.52 
 
 		 692 aa  962    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0333221  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1191  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  60.63 
 
 		 730 aa  876    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.112053 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18290  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.84 
 
 		 816 aa  693    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0421  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.55 
 
 		 689 aa  673    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2681  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.07 
 
 		 681 aa  674    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1782  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.16 
 
 		 687 aa  729    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.309606  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0087  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.45 
 
 		 678 aa  699    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1190  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  61.13 
 
 		 690 aa  895    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.629609 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2383  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.94 
 
 		 583 aa  644    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3480  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.18 
 
 		 627 aa  631  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.308899  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0513  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  53.11 
 
 		 623 aa  625  1e-178  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0978  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.82 
 
 		 630 aa  622  1e-177  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0052  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  46.08 
 
 		 701 aa  622  1e-177  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2207  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.3 
 
 		 636 aa  621  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1897  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.85 
 
 		 700 aa  617  1e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000617448  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4058  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.83 
 
 		 707 aa  612  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1124  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.71 
 
 		 701 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0021  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.63 
 
 		 689 aa  610  1e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0862  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.4 
 
 		 698 aa  608  9.999999999999999e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1239  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.96 
 
 		 698 aa  608  9.999999999999999e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0426  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  47.09 
 
 		 893 aa  584  1.0000000000000001e-165  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0922  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.56 
 
 		 603 aa  514  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0018873  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2140  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic  31.1 
 
 		 604 aa  296  7e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0335  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  32.18 
 
 		 639 aa  296  9e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0226  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.8 
 
 		 606 aa  271  2e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00295512  normal  0.636245 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0378  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.68 
 
 		 606 aa  269  1e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.73925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0693  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  28.41 
 
 		 676 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1315  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  28.69 
 
 		 665 aa  226  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  29.38 
 
 		 670 aa  223  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00598152  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1471  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.23 
 
 		 791 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0823956  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1264  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.82 
 
 		 757 aa  217  7e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1227  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.23 
 
 		 791 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.25361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0728  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.23 
 
 		 791 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1241  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.61 
 
 		 768 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1037  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.45 
 
 		 794 aa  211  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2125  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic  26.03 
 
 		 795 aa  207  4e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1709  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  24.79 
 
 		 729 aa  196  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.37084  normal  0.962823 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0320  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.27 
 
 		 731 aa  192  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.706326  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2811  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic  26.99 
 
 		 732 aa  191  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.140611 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0306  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  27.54 
 
 		 656 aa  190  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.674965  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0633  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  28.21 
 
 		 709 aa  187  7e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0332169  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0127  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  26.85 
 
 		 736 aa  184  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0009  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  25.28 
 
 		 730 aa  179  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0630863 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2830  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  26.79 
 
 		 705 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2516  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  26.4 
 
 		 705 aa  171  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1233  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  23.87 
 
 		 704 aa  158  3e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1071  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  35.61 
 
 		 1197 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00208711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1054  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.61 
 
 		 746 aa  149  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0277  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25.23 
 
 		 747 aa  149  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2086  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  26 
 
 		 723 aa  143  9e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>