286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1401 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_11050  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.7 
 
 
676 aa  664    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.177908  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3580  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.32 
 
 
683 aa  665    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3397  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.6 
 
 
686 aa  739    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0535  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.65 
 
 
800 aa  738    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000021031  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3480  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.28 
 
 
627 aa  647    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.308899  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1331  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  55.44 
 
 
708 aa  741    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0843156  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1601  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.8 
 
 
706 aa  676    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2570  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.86 
 
 
730 aa  694    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.980594  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0963  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.77 
 
 
683 aa  672    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.391943 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1144  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.5 
 
 
692 aa  746    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0333221  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2622  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.23 
 
 
719 aa  677    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0892  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.07 
 
 
695 aa  686    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0982994  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0068  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.34 
 
 
697 aa  751    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18290  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.59 
 
 
816 aa  728    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1995  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.22 
 
 
709 aa  694    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0898162  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0629  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.61 
 
 
583 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00137002  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1698  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.85 
 
 
627 aa  689    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1190  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.63 
 
 
690 aa  664    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.629609 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2171  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.22 
 
 
676 aa  668    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00664522  hitchhiker  0.00155539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2106  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.02 
 
 
687 aa  665    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.849515  normal  0.994993 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2809  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.61 
 
 
583 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  55.3 
 
 
695 aa  764    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0646  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.57 
 
 
696 aa  672    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132822  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0277  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  55.17 
 
 
638 aa  727    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3016  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.02 
 
 
685 aa  739    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2207  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.43 
 
 
636 aa  636    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1276  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.2 
 
 
673 aa  692    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1449  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.58 
 
 
705 aa  740    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.437594 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1809  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.8 
 
 
596 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2383  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.61 
 
 
583 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0368  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.64 
 
 
675 aa  662    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2742  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.61 
 
 
583 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2685  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.61 
 
 
583 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3517  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.9 
 
 
673 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0106  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.07 
 
 
675 aa  683    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2768  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  52.11 
 
 
608 aa  659    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.722905  hitchhiker  0.0000187982 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1782  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.02 
 
 
687 aa  666    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.309606  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0513  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  56.9 
 
 
623 aa  719    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1698  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.61 
 
 
583 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1191  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  48.6 
 
 
730 aa  687    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.112053 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1057  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.79 
 
 
721 aa  683    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1819  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.72 
 
 
636 aa  710    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2273  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.49 
 
 
718 aa  711    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.414975  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0305  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.12 
 
 
629 aa  639    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.113243 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2904  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.61 
 
 
587 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39690  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.03 
 
 
675 aa  673    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.192369  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1473  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.02 
 
 
704 aa  738    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4657  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.32 
 
 
683 aa  665    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.68774  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0978  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  71.33 
 
 
630 aa  924    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2340  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.25 
 
 
591 aa  655    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.855235  normal  0.0211703 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1779  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.76 
 
 
669 aa  691    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0307976  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2642  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.85 
 
 
673 aa  686    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3365  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.48 
 
 
675 aa  669    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172417  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0421  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.95 
 
 
689 aa  734    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2681  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.24 
 
 
681 aa  727    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0906  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.79 
 
 
715 aa  697    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2718  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.25 
 
 
591 aa  655    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.529352  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0087  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  50.07 
 
 
678 aa  674    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2730  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  51.94 
 
 
813 aa  726    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.453605  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1401  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  100 
 
 
710 aa  1478    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00712493  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5139  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  52.88 
 
 
574 aa  631  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.766107  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2989  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  53.86 
 
 
581 aa  630  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.935687  normal  0.463856 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0454  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  47.2 
 
 
703 aa  618  1e-176  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000238531  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0862  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.84 
 
 
698 aa  599  1e-170  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0052  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  46.21 
 
 
701 aa  590  1e-167  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0426  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.07 
 
 
893 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4058  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.69 
 
 
707 aa  584  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1897  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45 
 
 
700 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000617448  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1124  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.71 
 
 
701 aa  575  1.0000000000000001e-162  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1239  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  44.48 
 
 
698 aa  571  1e-161  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0021  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  43.98 
 
 
689 aa  561  1e-158  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0922  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  46.58 
 
 
603 aa  536  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0018873  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0335  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  33.23 
 
 
639 aa  341  2e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2140  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic  32.23 
 
 
604 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0378  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.16 
 
 
606 aa  291  3e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.73925  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0226  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  31.06 
 
 
606 aa  288  2e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00295512  normal  0.636245 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0728  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  28.16 
 
 
791 aa  250  8e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1227  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  27.87 
 
 
791 aa  246  9e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.25361  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1471  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  28.02 
 
 
791 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0823956  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1241  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  28.41 
 
 
768 aa  239  1e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0633  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  28.72 
 
 
709 aa  234  6e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0332169  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1264  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  31.34 
 
 
757 aa  225  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1315  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  30.99 
 
 
665 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1037  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  28.5 
 
 
794 aa  207  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2125  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic  29.93 
 
 
795 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0693  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  28.69 
 
 
676 aa  196  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0320  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  28.65 
 
 
731 aa  194  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.706326  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2811  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic  28.61 
 
 
732 aa  193  9e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.140611 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2830  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  26.47 
 
 
705 aa  192  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2516  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  26.47 
 
 
705 aa  192  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1709  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  27.35 
 
 
729 aa  188  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.37084  normal  0.962823 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  26.53 
 
 
670 aa  187  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00598152  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0009  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  27.81 
 
 
730 aa  179  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0630863 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0306  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  30.11 
 
 
656 aa  179  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.674965  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1468  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  26.29 
 
 
708 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.897136  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0550  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25.23 
 
 
651 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0536  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25.05 
 
 
651 aa  164  7e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4703  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25.43 
 
 
712 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1249  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  26.96 
 
 
632 aa  161  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0127  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  25.71 
 
 
736 aa  160  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>