16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0810 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0810  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  552  1e-156  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.471857 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1729  hypothetical protein  32.71 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0966  hypothetical protein  35.56 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.477244  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1306  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.812984  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1876  hypothetical protein  35.45 
 
 
265 aa  142  5e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1036  hypothetical protein  33.94 
 
 
273 aa  138  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000026876 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0231  hypothetical protein  31.64 
 
 
273 aa  115  6e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0268  hypothetical protein  32.5 
 
 
275 aa  115  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000102281  hitchhiker  0.000000197232 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2291  Protein of unknown function DUF171  29.04 
 
 
301 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14068  predicted protein  27.97 
 
 
330 aa  95.5  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.763403  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1827  Protein of unknown function DUF171  27.46 
 
 
282 aa  94.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.750424 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2217  Protein of unknown function DUF171  28.57 
 
 
301 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0209  Protein of unknown function DUF171  27.02 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2450  Protein of unknown function DUF171  27.52 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1779  Protein of unknown function DUF171  26.69 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.68141  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0090  hypothetical protein  22.71 
 
 
242 aa  45.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000142872  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>