14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2450 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2450  Protein of unknown function DUF171  100 
 
 
288 aa  560  1e-158  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1827  Protein of unknown function DUF171  63.03 
 
 
282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.750424 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2291  Protein of unknown function DUF171  54.67 
 
 
301 aa  293  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2217  Protein of unknown function DUF171  56.81 
 
 
301 aa  293  3e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0209  Protein of unknown function DUF171  52.7 
 
 
316 aa  280  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1729  hypothetical protein  36.15 
 
 
277 aa  126  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0810  hypothetical protein  28.52 
 
 
270 aa  102  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.471857 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0268  hypothetical protein  26.96 
 
 
275 aa  89.7  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000102281  hitchhiker  0.000000197232 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1306  hypothetical protein  30.93 
 
 
263 aa  89.4  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.812984  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1036  hypothetical protein  28.08 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000026876 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0966  hypothetical protein  27.89 
 
 
263 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.477244  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1876  hypothetical protein  28.91 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14068  predicted protein  25.39 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.763403  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0231  hypothetical protein  29.45 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>