16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1729 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1729  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  558  1e-158  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0810  hypothetical protein  32.71 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.471857 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1827  Protein of unknown function DUF171  38.46 
 
 
282 aa  145  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.750424 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2291  Protein of unknown function DUF171  37.22 
 
 
301 aa  139  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0209  Protein of unknown function DUF171  35.62 
 
 
316 aa  136  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0231  hypothetical protein  36.23 
 
 
273 aa  132  6e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2217  Protein of unknown function DUF171  36.07 
 
 
301 aa  132  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1306  hypothetical protein  36.36 
 
 
263 aa  122  6e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.812984  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1876  hypothetical protein  34.31 
 
 
265 aa  120  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0966  hypothetical protein  33.7 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.477244  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0268  hypothetical protein  32.38 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000102281  hitchhiker  0.000000197232 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1036  hypothetical protein  32.27 
 
 
273 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000026876 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2450  Protein of unknown function DUF171  35.59 
 
 
288 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14068  predicted protein  30.31 
 
 
330 aa  90.1  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.763403  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1779  Protein of unknown function DUF171  23.55 
 
 
265 aa  52.8  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.68141  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0090  hypothetical protein  24 
 
 
242 aa  46.6  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000142872  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>