13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1779 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1779  Protein of unknown function DUF171  100 
 
 
265 aa  527  1e-149  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.68141  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0090  hypothetical protein  39.76 
 
 
242 aa  178  7e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000142872  hitchhiker  0.00000554802 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1306  hypothetical protein  27.57 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.812984  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0966  hypothetical protein  28.4 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.477244  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1876  hypothetical protein  26.45 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1729  hypothetical protein  23.08 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0810  hypothetical protein  27.68 
 
 
270 aa  58.9  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.471857 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0268  hypothetical protein  25.31 
 
 
275 aa  52.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000102281  hitchhiker  0.000000197232 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0231  hypothetical protein  27.09 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1036  hypothetical protein  23.46 
 
 
273 aa  48.9  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000026876 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1827  Protein of unknown function DUF171  28.71 
 
 
282 aa  45.8  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.750424 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2291  Protein of unknown function DUF171  25.42 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0209  Protein of unknown function DUF171  27.45 
 
 
316 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>