53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0565 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0565  methyltransferase type 12  100 
 
 
248 aa  509  1e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.479593 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1175  Methyltransferase type 12  33.64 
 
 
245 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
258 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
280 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  32.5 
 
 
221 aa  48.5  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  41.51 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1966  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000755977  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  26.72 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  22.79 
 
 
282 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  26.72 
 
 
269 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  25.66 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  25.66 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  25.66 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  25.86 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  27.59 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  27.59 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  25.86 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  27.59 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  27.59 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  27.59 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1427  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
237 aa  45.8  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.527187  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2399  Methyltransferase type 11  22.22 
 
 
210 aa  45.8  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.521103  normal  0.920683 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1490  methyltransferase type 11  40.35 
 
 
211 aa  45.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0869674  normal  0.806662 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0411  hypothetical protein  27.78 
 
 
264 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0624483  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  24.11 
 
 
275 aa  45.4  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.21 
 
 
280 aa  45.4  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  24.53 
 
 
365 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  33.87 
 
 
415 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04141  putative methyltransferase  26.4 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  23.6 
 
 
246 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07904  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
325 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.414403  normal  0.323526 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04351  putative methyltransferase  27.78 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3311  Methyltransferase type 11  24.78 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04661  putative methyltransferase  27.78 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.3 
 
 
254 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  38.3 
 
 
274 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  21.89 
 
 
252 aa  42.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  31.03 
 
 
249 aa  42.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 
270 aa  42.7  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  22.56 
 
 
240 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  27.27 
 
 
266 aa  42.7  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  25.29 
 
 
340 aa  42.7  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  22.3 
 
 
269 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.91 
 
 
253 aa  42.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
268 aa  42.4  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  28.81 
 
 
202 aa  42.7  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  23.81 
 
 
239 aa  42.4  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0301  methyltransferase type 11  19.61 
 
 
380 aa  42  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1115  methyltransferase type 11  25 
 
 
252 aa  42  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1420  Methyltransferase type 11  25.6 
 
 
266 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 
260 aa  42  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>