27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3157 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_3157  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  100 
 
 		 178 aa  358  3e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.484396  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0965  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  94.19 
 
 		 172 aa  306  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1708  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  85.47 
 
 		 174 aa  285  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2330  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  82.46 
 
 		 179 aa  270  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0285  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  79.89 
 
 		 174 aa  266  2e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137025  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0372  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  45.57 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000142035  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1650  transcription factor TFIIE, alpha subunit  43.21 
 
 		 167 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2797  transcription factor TFIIE, alpha subunit  39.29 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0196  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  44.38 
 
 		 164 aa  135  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1524  transcription factor TFIIE, alpha subunit  37.87 
 
 		 173 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2009  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  38.24 
 
 		 173 aa  131  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.735877  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1279  transcription factor TFIIE, alpha subunit  36.14 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  35.33 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  35.5 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0325255 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1644  transcription initiation factor E subunit alpha  35.12 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.275573  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0913  transcription initiation factor E subunit alpha  34.91 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1150  transcription initiation factor E subunit alpha  34.12 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0458  hypothetical protein  31.53 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1244  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  39.55 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2279  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  36.05 
 
 		 176 aa  101  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.933385 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1607  transcription factor TFIIE subunit alpha  29.17 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0710  transcription factor TFIIE, alpha subunit  34.06 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0035  transcription factor TFIIE, alpha subunit  26.72 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0032  transcription factor TFIIE, alpha subunit  24.03 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00767088 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2147  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  26.72 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1074  transcription factor TFIIE, alpha subunit  22.41 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1388  transcription factor TFIIE, alpha subunit  26.12 
 
 		 183 aa  44.7  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>