27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1279 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1279  transcription factor TFIIE, alpha subunit  100 
 
 		 173 aa  361  2e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2009  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  61.05 
 
 		 173 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.735877  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1524  transcription factor TFIIE, alpha subunit  58.96 
 
 		 173 aa  219  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2797  transcription factor TFIIE, alpha subunit  54.34 
 
 		 173 aa  202  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0458  hypothetical protein  43.96 
 
 		 211 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1650  transcription factor TFIIE, alpha subunit  39.88 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1708  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  38.55 
 
 		 174 aa  124  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2330  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  37.95 
 
 		 179 aa  121  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0285  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  37.95 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137025  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3157  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  36.14 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.484396  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0372  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  35.4 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000142035  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0965  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  36.75 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0196  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  35.22 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0913  transcription initiation factor E subunit alpha  31.1 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  30.49 
 
 		 185 aa  104  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0325255 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1644  transcription initiation factor E subunit alpha  30.49 
 
 		 185 aa  104  8e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.275573  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1150  transcription initiation factor E subunit alpha  30.59 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  29.27 
 
 		 185 aa  97.8  7e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1607  transcription factor TFIIE subunit alpha  33.12 
 
 		 171 aa  94.7  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2279  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  33.8 
 
 		 176 aa  92  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.933385 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1244  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  29.66 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0710  transcription factor TFIIE, alpha subunit  29.73 
 
 		 178 aa  84.7  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1074  transcription factor TFIIE, alpha subunit  24.79 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0035  transcription factor TFIIE, alpha subunit  26.45 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0032  transcription factor TFIIE, alpha subunit  28.89 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00767088 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2147  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  23.14 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1388  transcription factor TFIIE, alpha subunit  22.99 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>