27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1644 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1644  transcription initiation factor E subunit alpha  100 
 
 		 185 aa  378  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.275573  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0913  transcription initiation factor E subunit alpha  97.84 
 
 		 185 aa  370  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  97.3 
 
 		 185 aa  368  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0325255 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  81.08 
 
 		 185 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1150  transcription initiation factor E subunit alpha  58.47 
 
 		 183 aa  239  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2279  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  39.86 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.933385 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0285  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  37.58 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1244  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  33.33 
 
 		 178 aa  111  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1524  transcription factor TFIIE, alpha subunit  31.93 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2330  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  35.71 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2009  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  33.54 
 
 		 173 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.735877  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0965  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  36.14 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1708  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  34.94 
 
 		 174 aa  105  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1279  transcription factor TFIIE, alpha subunit  30.49 
 
 		 173 aa  104  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3157  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  34.94 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.484396  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0458  hypothetical protein  37.01 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1650  transcription factor TFIIE, alpha subunit  31.06 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2797  transcription factor TFIIE, alpha subunit  34.03 
 
 		 173 aa  98.6  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0196  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  32.3 
 
 		 164 aa  97.8  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0710  transcription factor TFIIE, alpha subunit  30.22 
 
 		 178 aa  88.6  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1607  transcription factor TFIIE subunit alpha  30.22 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0372  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  29.19 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000142035  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2147  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  27.64 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0035  transcription factor TFIIE, alpha subunit  25.19 
 
 		 170 aa  51.2  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0032  transcription factor TFIIE, alpha subunit  23.08 
 
 		 170 aa  48.1  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00767088 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1074  transcription factor TFIIE, alpha subunit  21.95 
 
 		 170 aa  48.5  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1388  transcription factor TFIIE, alpha subunit  21.05 
 
 		 183 aa  44.7  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>