26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0196 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0196  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  100 
 
 		 164 aa  336  5.9999999999999996e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0372  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  62.8 
 
 		 165 aa  229  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000142035  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1650  transcription factor TFIIE, alpha subunit  45.73 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2330  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  44.3 
 
 		 179 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0285  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  43.75 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137025  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1524  transcription factor TFIIE, alpha subunit  40.74 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0965  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  44.94 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1708  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  43.75 
 
 		 174 aa  124  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3157  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  44.38 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.484396  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2797  transcription factor TFIIE, alpha subunit  35.9 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2279  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  38.41 
 
 		 176 aa  117  6e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.933385 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1244  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  39.04 
 
 		 178 aa  114  7.999999999999999e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2009  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  37.04 
 
 		 173 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.735877  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1279  transcription factor TFIIE, alpha subunit  35.22 
 
 		 173 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0458  hypothetical protein  32.16 
 
 		 211 aa  102  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1150  transcription initiation factor E subunit alpha  34.81 
 
 		 183 aa  100  8e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  32.3 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0325255 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0913  transcription initiation factor E subunit alpha  32.3 
 
 		 185 aa  98.6  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1644  transcription initiation factor E subunit alpha  32.3 
 
 		 185 aa  97.8  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.275573  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  32.7 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1607  transcription factor TFIIE subunit alpha  32.12 
 
 		 171 aa  87.8  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0710  transcription factor TFIIE, alpha subunit  34.09 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1074  transcription factor TFIIE, alpha subunit  23.62 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2147  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  25 
 
 		 170 aa  47.8  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0032  transcription factor TFIIE, alpha subunit  23.66 
 
 		 170 aa  47.4  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00767088 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0035  transcription factor TFIIE, alpha subunit  25.2 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>