20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2004 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2004  PKD domain containing protein  100 
 
 
584 aa  1142    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.361042  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2003  hypothetical protein  71.19 
 
 
941 aa  179  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.390581  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2002  hypothetical protein  46.37 
 
 
198 aa  117  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.77 
 
 
1710 aa  62.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  33.09 
 
 
816 aa  58.9  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4208  hypothetical protein  41.24 
 
 
486 aa  58.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  32.47 
 
 
717 aa  57  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2734  hypothetical protein  31.21 
 
 
1374 aa  54.7  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  34.15 
 
 
1057 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  31.75 
 
 
963 aa  51.2  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0478  hypothetical protein  43.75 
 
 
519 aa  49.3  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.156904 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0427  hypothetical protein  40.54 
 
 
189 aa  47.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.176297  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  35.37 
 
 
623 aa  47.4  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  33.33 
 
 
552 aa  47  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0884  hypothetical protein  30.58 
 
 
1578 aa  46.2  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0424461  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  35.21 
 
 
816 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2471  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.19 
 
 
1489 aa  43.9  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  33.33 
 
 
820 aa  43.9  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3048  hypothetical protein  35.92 
 
 
175 aa  43.9  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.987312  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 
1601 aa  43.5  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>