17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3048 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3048  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  350  8e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.987312  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  44.14 
 
 
963 aa  94.7  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  41.38 
 
 
816 aa  87.8  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0427  hypothetical protein  37.34 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.176297  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1482  hypothetical protein  43.28 
 
 
470 aa  82.8  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  41.03 
 
 
996 aa  62.4  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  35.29 
 
 
767 aa  57  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  31.54 
 
 
693 aa  50.8  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  38.64 
 
 
1862 aa  48.5  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4208  hypothetical protein  28.57 
 
 
486 aa  48.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  28.57 
 
 
685 aa  46.2  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0441  surface protein  39.33 
 
 
681 aa  45.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  28.32 
 
 
618 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2004  PKD domain containing protein  35.92 
 
 
584 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.361042  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  37.36 
 
 
717 aa  42.4  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0396  triple helix repeat-containing collagen  37.36 
 
 
684 aa  42  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0162411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  34.43 
 
 
536 aa  42  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>