119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1471 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1471  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
129 aa  270  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.441246  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  88.37 
 
 
129 aa  246  6e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3464  hypothetical protein  75 
 
 
148 aa  210  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1958  hypothetical protein  40.44 
 
 
153 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1883  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45 
 
 
137 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2710  glyoxalase/bleomycin resistance protein, GloA-like  40.15 
 
 
156 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5647  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.69 
 
 
153 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.680123  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4963  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.14 
 
 
160 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460855  normal  0.230969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0038  hypothetical protein  35.97 
 
 
157 aa  93.6  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0588  putative dioxygenase  40.34 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258406  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0520  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.2 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0210  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.84 
 
 
121 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.658895  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2711  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.48 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.503668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4094  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.41 
 
 
142 aa  90.5  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0239  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.84 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3386  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.19 
 
 
128 aa  88.2  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0613632 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2195  glyoxalase family protein  38.76 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0414  hypothetical protein  39.83 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1889  glyoxalase family protein  37.1 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0900  glyoxalase family protein  37.1 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1188  glyoxalase family protein  37.1 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0355  glyoxalase family protein  37.1 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0264  glyoxalase family protein  37.1 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215438  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2163  glyoxalase family protein  37.1 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.273953  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1714  glyoxalase family protein  37.1 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3889  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.48 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2863  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.34 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4351  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.87 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224239  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1379  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.11 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0756  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.282007  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0746  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.65 
 
 
128 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097338 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1779  hypothetical protein  28.7 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2144  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.13 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3327  hypothetical protein  34.71 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.11232 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0632  hypothetical protein  33.61 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2172  hypothetical protein  35.04 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0402357  normal  0.019494 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1848  hypothetical protein  34.19 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  decreased coverage  0.0044175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2017  hypothetical protein  35.04 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131595  normal  0.188182 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3718  hypothetical protein  34.45 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.111188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1155  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.9 
 
 
124 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1466  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
128 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0096  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.87 
 
 
161 aa  60.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3961  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.77 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1275  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.01 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0592  hypothetical protein  26.67 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2268  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.3 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337413  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3471  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.6 
 
 
120 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3119  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.48 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2912  hypothetical protein  36 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0209  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0253  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.52 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1884  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
126 aa  50.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.173624  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.54 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0449  lactoylglutathione lyase  30.95 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00132524  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0440  lactoylglutathione lyase  30.95 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281062  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3087  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.6 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867854 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2154  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
127 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1035  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.78 
 
 
128 aa  48.1  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013055  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2029  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.78 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0815  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.34 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1785  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.35 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439636  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  26.72 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1288  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.86 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.38 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1223  hypothetical protein  29.41 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  26.45 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2287  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.15 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3002  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.81 
 
 
130 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0414369 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0273  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28 
 
 
206 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  26.45 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.98 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  27.5 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2450  lactoylglutathione lyase  30.58 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00862071  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0960  glyoxalase family protein  33.01 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.189194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1720  lactoylglutathione lyase  27.69 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000901416  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1001  putative ring-cleavage dioxygenase  27.13 
 
 
180 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2195  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.99 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.811141  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1772  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.2 
 
 
204 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2037  lactoylglutathione lyase  28.24 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2304  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.67 
 
 
193 aa  42.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1865  lactoylglutathione lyase  26.67 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.296961  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0027  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.4 
 
 
204 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0562097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2364  methylmalonyl-CoA epimerase  28.47 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1837  lactoylglutathione lyase  27.91 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429943  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  27.61 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0364  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.97 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.276612  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0307  hypothetical protein  28.81 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2073  lactoylglutathione lyase  27.61 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  26.67 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  27.61 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04140  Glyoxalase/Bleomycin resistance/Dioxygenase superfamily protein  25.98 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0503  glyoxalase I  28.1 
 
 
135 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457828  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4630  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.21 
 
 
185 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2931  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.56 
 
 
130 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2563  lactoylglutathione lyase  27.48 
 
 
136 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1773  glyoxalase family protein  30.61 
 
 
139 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00831345  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1910  glyoxalase family protein  30.61 
 
 
139 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000915588  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0386  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.18 
 
 
308 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000216536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0396  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.18 
 
 
308 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>