89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3464 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3464  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  303  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1471  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  75 
 
 
129 aa  210  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.441246  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  75.59 
 
 
129 aa  208  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5647  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.16 
 
 
153 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.680123  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1958  hypothetical protein  40.46 
 
 
153 aa  99.4  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0038  hypothetical protein  35.57 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4963  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 
160 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460855  normal  0.230969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0520  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.27 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1883  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.16 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2710  glyoxalase/bleomycin resistance protein, GloA-like  34.84 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0210  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.68 
 
 
121 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.658895  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3386  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.52 
 
 
128 aa  92  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0613632 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0588  putative dioxygenase  39.5 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258406  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4094  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.68 
 
 
142 aa  87.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0239  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.17 
 
 
121 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2711  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.89 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.503668 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1379  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.46 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2163  glyoxalase family protein  38.71 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.273953  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1188  glyoxalase family protein  38.71 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0900  glyoxalase family protein  38.71 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0355  glyoxalase family protein  38.71 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0264  glyoxalase family protein  38.71 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215438  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1889  glyoxalase family protein  38.71 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1714  glyoxalase family protein  38.71 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2195  glyoxalase family protein  37.98 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3889  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.61 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2172  hypothetical protein  36.64 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0402357  normal  0.019494 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1848  hypothetical protein  36.03 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  decreased coverage  0.0044175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0756  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.67 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.282007  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0414  hypothetical protein  38.14 
 
 
131 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4351  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224239  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2863  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.46 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2017  hypothetical protein  35.51 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131595  normal  0.188182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0746  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.15 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097338 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3718  hypothetical protein  36.97 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.111188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0632  hypothetical protein  33.61 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3327  hypothetical protein  35.25 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.11232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0592  hypothetical protein  30.63 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1155  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.04 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2144  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.77 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1779  hypothetical protein  26.77 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3961  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.59 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1466  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.79 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0096  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.84 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1275  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.55 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0253  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2154  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.3 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2195  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.09 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.811141  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0960  glyoxalase family protein  36.89 
 
 
108 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.189194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2912  hypothetical protein  37.11 
 
 
120 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1772  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.1 
 
 
204 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2268  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.28 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337413  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3471  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.83 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0273  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.1 
 
 
206 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2029  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.4 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0027  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.94 
 
 
204 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0562097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2367  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.78 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.015885 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.06 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0815  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.62 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3065  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.656499  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1223  hypothetical protein  32.48 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0281  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.69 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3087  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.23 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1329  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.47 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  30.58 
 
 
136 aa  44.3  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3300  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.16 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.58 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0132  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.6 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3119  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.23 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  28.57 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  29.63 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4630  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.26 
 
 
185 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1250  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.4 
 
 
152 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1288  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.28 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2568  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.13 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.476855  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3002  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.23 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0414369 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.17 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140373 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3244  glyoxylase family protein  29.37 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.201718  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3147  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.13 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4359  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  hitchhiker  0.00717168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.93 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2910  lactoylglutathione lyase, glyoxylase family protein  29.37 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2450  lactoylglutathione lyase  30.25 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00862071  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1035  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.33 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013055  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1785  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.74 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439636  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  28.68 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2424  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.53 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.780094  hitchhiker  0.00163116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2800  glyoxalase family protein  23.53 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  30 
 
 
138 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>