49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0414 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0414  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  262  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0632  hypothetical protein  64.62 
 
 
132 aa  171  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3327  hypothetical protein  66.15 
 
 
144 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.11232 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1188  glyoxalase family protein  43.31 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0900  glyoxalase family protein  43.31 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0355  glyoxalase family protein  43.31 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0264  glyoxalase family protein  43.31 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215438  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1889  glyoxalase family protein  43.31 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2163  glyoxalase family protein  43.31 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.273953  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1714  glyoxalase family protein  43.31 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1779  hypothetical protein  37.5 
 
 
146 aa  84  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1471  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.83 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.441246  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2195  glyoxalase family protein  41.54 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.98 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1958  hypothetical protein  36.51 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0746  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.16 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3464  hypothetical protein  38.14 
 
 
148 aa  77  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2144  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.15 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0210  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.17 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.658895  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2710  glyoxalase/bleomycin resistance protein, GloA-like  38.93 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1883  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.16 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3889  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.74 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4351  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.84 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224239  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3718  hypothetical protein  36.67 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.111188 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1379  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.71 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0239  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.44 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2912  hypothetical protein  34.96 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0038  hypothetical protein  34.29 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0520  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.29 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0588  putative dioxygenase  46.34 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258406  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2017  hypothetical protein  34.45 
 
 
134 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131595  normal  0.188182 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4094  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.37 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1466  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.8 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1848  hypothetical protein  35.65 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  decreased coverage  0.0044175 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2172  hypothetical protein  35.92 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0402357  normal  0.019494 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0592  hypothetical protein  26.09 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0756  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.61 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.282007  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4963  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.56 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460855  normal  0.230969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5647  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.88 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.680123  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2711  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.26 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.503668 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0096  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.77 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2029  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.08 
 
 
140 aa  47.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3386  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.45 
 
 
128 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0613632 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1155  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.6 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2863  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1288  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.09 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3236  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.06 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.912407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.56 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0960  glyoxalase family protein  33.63 
 
 
108 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.189194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>