67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0588 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0588  putative dioxygenase  100 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258406  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1883  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.16 
 
 		 137 aa  155  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1471  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.34 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.441246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3464  hypothetical protein  39.5 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.5 
 
 		 129 aa  90.1  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0520  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.33 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2710  glyoxalase/bleomycin resistance protein, GloA-like  39.58 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0038  hypothetical protein  38.69 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1958  hypothetical protein  36.8 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5647  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.86 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.680123  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2711  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.6 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.503668 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1188  glyoxalase family protein  38.33 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2163  glyoxalase family protein  38.33 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.273953  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3889  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.03 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0264  glyoxalase family protein  38.33 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215438  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1889  glyoxalase family protein  38.33 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0900  glyoxalase family protein  38.33 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0355  glyoxalase family protein  38.33 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2195  glyoxalase family protein  37.7 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1714  glyoxalase family protein  38.33 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4963  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.43 
 
 		 160 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460855  normal  0.230969 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4351  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.67 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3327  hypothetical protein  37.1 
 
 		 144 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.11232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0210  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.76 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.658895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1848  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  decreased coverage  0.0044175 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2172  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0402357  normal  0.019494 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0414  hypothetical protein  46.34 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3386  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.19 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0613632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0632  hypothetical protein  35.35 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0746  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.81 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097338 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2144  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.58 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0239  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.03 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0096  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.91 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3718  hypothetical protein  31.62 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.111188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1779  hypothetical protein  30.25 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1379  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.19 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2017  hypothetical protein  36.36 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131595  normal  0.188182 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2863  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.09 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1466  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2268  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.23 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337413  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0592  hypothetical protein  32.88 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4094  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.29 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3896  lactoylglutathione lyase  30.66 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0883965 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3847  lactoylglutathione lyase  30.66 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0756  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.03 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.282007  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2912  hypothetical protein  36.36 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.23 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1155  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.58 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2931  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.77 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3244  glyoxylase family protein  23.77 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.201718  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1223  hypothetical protein  37.7 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00185  predicted lyase  25.4 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1288  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 123 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00184  hypothetical protein  25.4 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.883797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2038  glyoxylase family protein  22.95 
 
 		 130 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0189  hypothetical protein  23.81 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.735348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3217  glyoxylase family protein  22.95 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2910  lactoylglutathione lyase, glyoxylase family protein  22.95 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3232  glyoxylase family protein  22.95 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0683516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2983  glyoxylase family protein  23.77 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3200  glyoxylase family protein  22.95 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0198  hypothetical protein  24.6 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3208  glyoxylase family protein  22.95 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2976  lactoylglutathione lyase, glyoxylase family protein  22.13 
 
 		 130 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3416  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.6 
 
 		 129 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0374  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.61 
 
 		 189 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4442  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  27.61 
 
 		 326 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.266673 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>