36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2144 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2144  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
135 aa  276  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1958  hypothetical protein  33.86 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2710  glyoxalase/bleomycin resistance protein, GloA-like  33.81 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0414  hypothetical protein  36.15 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.82 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1471  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.13 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.441246  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0038  hypothetical protein  33.09 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3327  hypothetical protein  35.66 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.11232 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0632  hypothetical protein  34.11 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3464  hypothetical protein  32.77 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0239  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.2 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0210  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.33 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.658895  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2195  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1883  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.07 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0746  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.07 
 
 
128 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3386  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.63 
 
 
128 aa  57.8  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0613632 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1889  glyoxalase family protein  32.81 
 
 
130 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0900  glyoxalase family protein  32.81 
 
 
130 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1188  glyoxalase family protein  32.81 
 
 
130 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0355  glyoxalase family protein  32.81 
 
 
130 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0264  glyoxalase family protein  32.81 
 
 
130 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215438  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2163  glyoxalase family protein  32.81 
 
 
130 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.273953  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1714  glyoxalase family protein  32.81 
 
 
130 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1779  hypothetical protein  28.91 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0588  putative dioxygenase  32.58 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258406  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3889  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.09 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4351  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.28 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224239  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0756  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.19 
 
 
130 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.282007  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4094  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.58 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1848  hypothetical protein  30.51 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  decreased coverage  0.0044175 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2172  hypothetical protein  30.51 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0402357  normal  0.019494 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2863  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.13 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5647  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.56 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.680123  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4963  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.38 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460855  normal  0.230969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2017  hypothetical protein  25.2 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131595  normal  0.188182 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06310  hypothetical protein  24 
 
 
127 aa  40  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.454344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>