67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5647 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5647  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
153 aa  314  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.680123  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4963  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  78.29 
 
 
160 aa  256  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460855  normal  0.230969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0038  hypothetical protein  44.76 
 
 
157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1958  hypothetical protein  40.71 
 
 
153 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2710  glyoxalase/bleomycin resistance protein, GloA-like  40.14 
 
 
156 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1471  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.69 
 
 
129 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.441246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3464  hypothetical protein  39.16 
 
 
148 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.43 
 
 
129 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3386  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.84 
 
 
128 aa  92.8  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0613632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4094  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.89 
 
 
142 aa  90.1  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1379  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.17 
 
 
134 aa  83.6  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0520  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.23 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0210  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.658895  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0588  putative dioxygenase  32.86 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258406  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0239  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.09 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0746  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097338 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2195  glyoxalase family protein  32.88 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1883  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.57 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2711  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.58 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.503668 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3718  hypothetical protein  36.13 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.111188 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2863  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.37 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4351  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.78 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224239  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1889  glyoxalase family protein  30.94 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2163  glyoxalase family protein  30.94 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.273953  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0264  glyoxalase family protein  30.94 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215438  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0355  glyoxalase family protein  30.94 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1188  glyoxalase family protein  30.94 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0900  glyoxalase family protein  30.94 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1714  glyoxalase family protein  30.94 
 
 
130 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1779  hypothetical protein  26.24 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2017  hypothetical protein  30.77 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131595  normal  0.188182 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3889  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.06 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2268  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.46 
 
 
138 aa  57.8  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1155  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.01 
 
 
124 aa  57.4  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2172  hypothetical protein  28.03 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0402357  normal  0.019494 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1884  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.12 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.173624  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1848  hypothetical protein  30.51 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  decreased coverage  0.0044175 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3961  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.15 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1466  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.06 
 
 
128 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0414  hypothetical protein  30.88 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0756  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.48 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.282007  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3327  hypothetical protein  29.08 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.11232 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0096  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.13 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3471  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.66 
 
 
120 aa  47.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0632  hypothetical protein  29.71 
 
 
132 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1946  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.8 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0209  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.01 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2686  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.2 
 
 
367 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.43 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.28 
 
 
123 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2144  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.56 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4693  glyoxylase family protein  26.62 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.133333  hitchhiker  0.000000000000906955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0815  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.87 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1738  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.78 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2284  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.38 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2573  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.34 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149975  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0592  hypothetical protein  30 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2292  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.38 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0442753  hitchhiker  0.00612299 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1873  glyoxalase I  26.95 
 
 
136 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3087  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.93 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867854 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27002  predicted protein  28.87 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00346607  normal  0.11675 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1491  glyoxalase I/lactoylglutathione lyase  28.26 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.111293  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3119  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.29 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0943  putative extradiol ring-cleaving dioxygenase  24.29 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  28.78 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0440  lactoylglutathione lyase  26.24 
 
 
126 aa  40.4  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281062  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1001  extradiol ring-cleaving dioxygenase, putative  26.43 
 
 
128 aa  40.4  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>