69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0960 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0960  glyoxalase family protein  100 
 
 
108 aa  222  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.189194  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1884  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.4 
 
 
126 aa  131  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.173624  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1223  hypothetical protein  59.22 
 
 
127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1155  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.58 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1466  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.81 
 
 
128 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0253  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.48 
 
 
129 aa  90.5  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27002  predicted protein  44.34 
 
 
142 aa  85.9  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00346607  normal  0.11675 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1288  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45 
 
 
123 aa  84.7  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3087  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.57 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867854 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3961  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.55 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3471  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.58 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.8 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0209  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.8 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3119  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.16 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4476  hypothetical protein  29.36 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.147519 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0659  hypothetical protein  32.26 
 
 
118 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0860  hypothetical protein  28.3 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0970  hypothetical protein  30.19 
 
 
117 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000478568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0898  hypothetical protein  29.25 
 
 
120 aa  57  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010673  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2287  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.58 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0902  hypothetical protein  28.3 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9505800000000003e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0769  hypothetical protein  28.3 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0717  lactoylglutathione lyase  28.3 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000259775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0704  lactoylglutathione lyase  28.3 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0037968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0806  hypothetical protein  28.3 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00929856  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2268  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.04 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337413  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2879  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.19 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3464  hypothetical protein  36.89 
 
 
148 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2613  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.64 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0658  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.26 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.283538  normal  0.26359 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0719  lactoylglutathione lyase  28.16 
 
 
121 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0096  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.36 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2213  hypothetical protein  30.48 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.666826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2682  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.91 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0832367  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1889  glyoxalase family protein  35.92 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0355  glyoxalase family protein  35.92 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0264  glyoxalase family protein  35.92 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215438  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1188  glyoxalase family protein  35.92 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0900  glyoxalase family protein  35.92 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2163  glyoxalase family protein  35.92 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.273953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2154  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.62 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1024  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808514  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1714  glyoxalase family protein  35.92 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0281  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.14 
 
 
154 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1471  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.01 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.441246  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.01 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.11 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0746  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.69 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.76 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.48 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1049  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.35 
 
 
131 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464949  normal  0.0262279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4103  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.43 
 
 
130 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.909574  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1779  hypothetical protein  33.7 
 
 
146 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2195  glyoxalase family protein  31.07 
 
 
143 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3343  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.53 
 
 
129 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0756  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.71 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.282007  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3782  hypothetical protein  39.51 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.26 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2789  glyoxalase family protein  34.07 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0211  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.188471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2200  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.15 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.335588  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0815  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.53 
 
 
138 aa  40.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0414  hypothetical protein  33.63 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1250  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
152 aa  40.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2747  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.06 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4654  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.11 
 
 
131 aa  40  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5611  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.19 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.431754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4213  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.02 
 
 
169 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>