99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2789 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2789  glyoxalase family protein  100 
 
 
142 aa  293  5e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3081  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  73.19 
 
 
138 aa  216  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0448436  normal  0.495021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0913  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.74 
 
 
140 aa  216  7e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.943234 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3000  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  72.46 
 
 
138 aa  215  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0247436  normal  0.442163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0992  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.57 
 
 
139 aa  215  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3178  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  72.46 
 
 
138 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3586  glyoxalase family protein  71.01 
 
 
138 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1078  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.57 
 
 
138 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1009  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.57 
 
 
138 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1016  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.29 
 
 
138 aa  209  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144748  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1111  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.57 
 
 
138 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00744956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3280  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.57 
 
 
138 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0562613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1045  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.22 
 
 
139 aa  207  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.702459 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0088  glyoxalase family protein  67.39 
 
 
138 aa  203  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0886  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.77 
 
 
139 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2124  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.32 
 
 
139 aa  189  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0194253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1566  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.31 
 
 
140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0760824  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001042  lactoylglutathione lyase  59.56 
 
 
139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04755  lactoylglutathione lyase  59.56 
 
 
139 aa  179  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4210  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.39 
 
 
152 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2166  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.69 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0593975  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2495  hypothetical protein  31.21 
 
 
138 aa  60.8  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.57 
 
 
150 aa  58.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3747  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.16 
 
 
126 aa  54.3  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2806  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.07 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1734  glyoxalase family protein  34.07 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2721  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.07 
 
 
131 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1574  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
131 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166496  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.07 
 
 
131 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.823568  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1544  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3172  glyoxalase family protein  27.91 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.139884  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.91 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.468879 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2800  glyoxalase family protein  28.46 
 
 
132 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2424  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 
132 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.780094  hitchhiker  0.00163116 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0145  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.5 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2621  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000365872  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1439  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2554  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0389  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.69 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.258603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0805  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.78 
 
 
217 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2033  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.68 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.57 
 
 
131 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0261666  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1581  glyoxalase family protein  30.4 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1155  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4542  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.33 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4693  glyoxylase family protein  25.95 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.133333  hitchhiker  0.000000000000906955 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2229  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.5 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1327  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.52 
 
 
188 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.894491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1024  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.23 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808514  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  30.88 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136753  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.59 
 
 
201 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2200  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
126 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.335588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.92 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1279  glyoxalase family protein family  28.1 
 
 
287 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4693  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.46 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.105988  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2032  fosfomycin resistance protein FosB  29.84 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1466  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5249  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.5 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2268  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.91 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5337  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.5 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5628  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.5 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615046  normal  0.490927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.5 
 
 
188 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2439  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.53 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.509697 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.13 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.21 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3746  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.98 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3277  fosfomycin resistance protein FosB  30.65 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2089  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.28 
 
 
148 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1001  extradiol ring-cleaving dioxygenase, putative  28.24 
 
 
128 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1892  fosfomycin resistance protein FosB  28.23 
 
 
138 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.05854  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1449  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.56 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444424  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0943  putative extradiol ring-cleaving dioxygenase  28.24 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1979  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.01 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4359  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.8 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  hitchhiker  0.00717168 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.4 
 
 
204 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.281044  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2409  Glutathione transferase  27.87 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121998  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3968  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.71 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.477474  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5200  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dihydroxybiphenyl dioxygenase  28.26 
 
 
201 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000172312  normal  0.0747764 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3795  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.19 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1779  hypothetical protein  32.69 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2155  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.24 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0614905  normal  0.240575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3961  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.69 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1590  glyoxalase family protein  27.45 
 
 
287 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1507  glyoxalase family protein  27.45 
 
 
287 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1474  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.58 
 
 
134 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.781159  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0645  glyoxylase family protein  24.43 
 
 
128 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4513  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.81 
 
 
178 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.824084 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0087  putative glyoxylase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  27.45 
 
 
287 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
182 aa  40.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0960  glyoxalase family protein  34.07 
 
 
108 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.189194  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1712  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.22 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.637248 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.56 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0520  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.19 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3208  glyoxylase family protein  31.25 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  26.32 
 
 
179 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4478  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
132 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.613578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2496  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.06 
 
 
129 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.130416 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0815  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.63 
 
 
138 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>