53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2124 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2124  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 139 aa  283  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0194253  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0992  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.5 
 
 		 139 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1045  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.19 
 
 		 139 aa  200  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.702459 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1016  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.67 
 
 		 138 aa  199  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144748  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1566  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.39 
 
 		 140 aa  199  9e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0760824  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0913  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.19 
 
 		 140 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.943234 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3000  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.94 
 
 		 138 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0247436  normal  0.442163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3178  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.67 
 
 		 138 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1111  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.22 
 
 		 138 aa  197  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00744956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1009  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.22 
 
 		 138 aa  197  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1078  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.22 
 
 		 138 aa  197  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3280  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.22 
 
 		 138 aa  197  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0562613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3081  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.94 
 
 		 138 aa  196  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0448436  normal  0.495021 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3586  glyoxalase family protein  63.04 
 
 		 138 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0886  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.31 
 
 		 139 aa  189  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2789  glyoxalase family protein  62.32 
 
 		 142 aa  189  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0088  glyoxalase family protein  60.87 
 
 		 138 aa  184  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001042  lactoylglutathione lyase  54.74 
 
 		 139 aa  173  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04755  lactoylglutathione lyase  56.62 
 
 		 139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4210  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.77 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2495  hypothetical protein  30.07 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3747  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.38 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2166  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.09 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0593975  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.89 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0261666  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.35 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136753  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0389  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.2 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.258603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2217  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.91 
 
 		 209 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335323 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2229  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1581  glyoxalase family protein  29.69 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0145  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.68 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2304  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 		 193 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  27.59 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0969  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.11 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.387103  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3491  lactoylglutathione lyase  27.14 
 
 		 142 aa  43.5  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3407  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.09 
 
 		 202 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827637 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2089  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2033  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.28 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4951  lactoylglutathione lyase  30.3 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0812  methylmalonyl-CoA epimerase  27.14 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0815  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.91 
 
 		 138 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2469  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.14 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1327  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.47 
 
 		 188 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.894491  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0805  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.69 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2200  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.07 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.335588  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1734  glyoxalase family protein  27.61 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1038  methylmalonyl-CoA epimerase  25.9 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00716429  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0178  lactoylglutathione lyase related lyase  30.56 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00765749  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0165  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.78 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0300216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.79 
 
 		 206 aa  40.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.216826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0440  lactoylglutathione lyase  25 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281062  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.25 
 
 		 166 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1994  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.79 
 
 		 209 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462315  hitchhiker  0.000819499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>