40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2912 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2912  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1848  hypothetical protein  52.17 
 
 		 133 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480851  decreased coverage  0.0044175 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2172  hypothetical protein  52.17 
 
 		 134 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0402357  normal  0.019494 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2017  hypothetical protein  49.17 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131595  normal  0.188182 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3718  hypothetical protein  44.92 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.111188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0592  hypothetical protein  40.52 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0414  hypothetical protein  34.96 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1471  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.441246  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1779  hypothetical protein  38.04 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3464  hypothetical protein  31.67 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0210  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.91 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.658895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0632  hypothetical protein  33.88 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0756  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.5 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.282007  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0588  putative dioxygenase  36.36 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258406  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3327  hypothetical protein  32.23 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.11232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1883  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.78 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3386  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0613632 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0239  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1958  hypothetical protein  30.08 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2711  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.09 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.503668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2710  glyoxalase/bleomycin resistance protein, GloA-like  30.47 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0520  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.93 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3889  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.62 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4351  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.69 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0355  glyoxalase family protein  33.87 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0264  glyoxalase family protein  33.87 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215438  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2163  glyoxalase family protein  33.87 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.273953  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1188  glyoxalase family protein  33.87 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0900  glyoxalase family protein  33.87 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0746  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.25 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097338 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1889  glyoxalase family protein  33.87 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2195  glyoxalase family protein  32.5 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1714  glyoxalase family protein  33.87 
 
 		 130 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1379  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5647  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.15 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.680123  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2144  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.08 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0038  hypothetical protein  29.73 
 
 		 157 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4963  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.62 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460855  normal  0.230969 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0096  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.58 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>