More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4719 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4719  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
495 aa  967    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0542  amino acid adenylation domain protein  37.48 
 
 
534 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.404103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0555  amino acid adenylation domain protein  36.41 
 
 
534 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000001061 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  33.14 
 
 
541 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  36.22 
 
 
2626 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  37.01 
 
 
1449 aa  244  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  37.21 
 
 
2651 aa  239  9e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  36.2 
 
 
1334 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  35.42 
 
 
1483 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  35.42 
 
 
1483 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  35.42 
 
 
1528 aa  237  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  35.42 
 
 
1520 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  35.52 
 
 
3291 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3920  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  31.15 
 
 
504 aa  236  9e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1287  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.62 
 
 
503 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1389  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.62 
 
 
503 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  35.9 
 
 
6006 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1259  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.75 
 
 
504 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  35.05 
 
 
3348 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1461  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.75 
 
 
504 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 
514 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1424  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.56 
 
 
504 aa  230  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1261  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.56 
 
 
504 aa  230  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1092  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  29.74 
 
 
504 aa  230  6e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  35.8 
 
 
5698 aa  229  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  35.15 
 
 
6176 aa  229  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0576  amino acid adenylation domain protein  30.89 
 
 
503 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2201  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  38.87 
 
 
2106 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  34.67 
 
 
1130 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1487  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.16 
 
 
504 aa  227  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1530  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.16 
 
 
504 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1294  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.36 
 
 
504 aa  226  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.711083  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  34.04 
 
 
2878 aa  226  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  34.77 
 
 
5213 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  31.84 
 
 
2883 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  33.2 
 
 
4747 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  33.54 
 
 
2573 aa  223  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  31.6 
 
 
1317 aa  223  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  35.42 
 
 
3331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  33.67 
 
 
3470 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  34.09 
 
 
7712 aa  221  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  37.35 
 
 
3629 aa  221  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  32.6 
 
 
3002 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  34.92 
 
 
4991 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  37.5 
 
 
7541 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  32.53 
 
 
2419 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  32.31 
 
 
1336 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3419  amino acid adenylation domain protein  35.41 
 
 
1872 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  30.08 
 
 
1142 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  32.6 
 
 
8646 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  36.26 
 
 
6999 aa  216  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  31.75 
 
 
13537 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  31.5 
 
 
5596 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1677  amino acid adenylation domain protein  31.14 
 
 
3289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  33.81 
 
 
5422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4498  amino acid adenylation domain protein  38.81 
 
 
1892 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.693218  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  33.6 
 
 
3639 aa  213  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  32.07 
 
 
6676 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1907  amino acid adenylation domain-containing protein  28.43 
 
 
625 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  33.4 
 
 
3432 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  34.52 
 
 
5750 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  34.07 
 
 
5953 aa  213  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  34.19 
 
 
2448 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  30.06 
 
 
2386 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  34.93 
 
 
5230 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  36.71 
 
 
2896 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4588  amino acid adenylation domain protein  37.25 
 
 
1925 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  29.66 
 
 
2581 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  33.84 
 
 
6081 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1883  non-ribosomal peptide synthetase  34.12 
 
 
1314 aa  211  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20791  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  34.52 
 
 
3335 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  31.42 
 
 
2867 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  35.67 
 
 
3710 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  28.71 
 
 
1336 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.25 
 
 
2385 aa  210  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5065  amino acid adenylation domain protein  35.98 
 
 
2333 aa  210  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  33.2 
 
 
9498 aa  210  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  31.34 
 
 
5469 aa  210  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.92 
 
 
1839 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  33.47 
 
 
1137 aa  209  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  34.22 
 
 
6072 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1704  non-ribosomal peptide synthase  34.43 
 
 
1082 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0269  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.43 
 
 
1082 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 
515 aa  209  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  32.48 
 
 
4383 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  30.78 
 
 
1753 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  28.14 
 
 
888 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34 
 
 
6889 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  35.29 
 
 
4318 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  31.54 
 
 
3021 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1791  non-ribosomal peptide synthase  34.24 
 
 
1082 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4746  amino acid adenylation  29.09 
 
 
983 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  31.88 
 
 
4882 aa  208  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  34.36 
 
 
1498 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  36.08 
 
 
1864 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1117  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.24 
 
 
1082 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  32.01 
 
 
2370 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1287  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.24 
 
 
1082 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0118  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.24 
 
 
1071 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0308  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.24 
 
 
1082 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>