177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0927 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0927  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 
281 aa  527  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.47 
 
 
270 aa  211  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6714  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  48.72 
 
 
266 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0693  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  46.47 
 
 
259 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0706  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  46.47 
 
 
259 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.10539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  46.47 
 
 
259 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1037  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  45.35 
 
 
276 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10538  cytochrome C-type biogenesis protein ccdA  45.02 
 
 
259 aa  206  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000404989  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0051  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  46.13 
 
 
261 aa  199  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0867  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  45.02 
 
 
264 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265338  normal  0.0292132 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2672  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.1 
 
 
270 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0690  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  45.66 
 
 
261 aa  191  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2825  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  43.38 
 
 
257 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447777  normal  0.192447 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5368  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.8 
 
 
278 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428452  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5681  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  43.54 
 
 
256 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.728105 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5329  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.8 
 
 
256 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.262903  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3693  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  43.17 
 
 
256 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4485  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  43.45 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02950  cytochrome c biogenesis protein  48.71 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4572  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.35 
 
 
272 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24340  cytochrome c biogenesis protein  43.32 
 
 
271 aa  166  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.71 
 
 
249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.71 
 
 
249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.71 
 
 
249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4432  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.66 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229211  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0270  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.29 
 
 
243 aa  156  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4519  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.03 
 
 
249 aa  156  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0363531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.01 
 
 
274 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0522  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.99 
 
 
258 aa  154  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0219549  hitchhiker  0.00315047 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0511  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.08 
 
 
311 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.166035  normal  0.182219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0573  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.52 
 
 
244 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2199  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.12 
 
 
276 aa  149  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2703  putative cytochrome C biogenesis membrane protein  43.75 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.524164  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4430  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.35 
 
 
253 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5009  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.35 
 
 
268 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.082972  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3253  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.5 
 
 
264 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0400175  normal  0.222904 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0252  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.86 
 
 
255 aa  143  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2733  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.47 
 
 
317 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0356838  normal  0.0597692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0502  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.31 
 
 
253 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3090  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.03 
 
 
251 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0826  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.5 
 
 
249 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0445  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.18 
 
 
250 aa  135  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.362789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3291  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.44 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402635  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07210  cytochrome c biogenesis protein  41.01 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.276836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4517  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.03 
 
 
285 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.321232  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  34.69 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493199  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4097  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.81 
 
 
285 aa  125  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.326435 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17960  cytochrome c biogenesis protein  38.19 
 
 
256 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6119  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.78 
 
 
342 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551753  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0455  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.26 
 
 
259 aa  122  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2134  putative cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  34.1 
 
 
248 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0478142  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4562  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.85 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0808  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.1 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0718  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.95 
 
 
248 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1457  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.5 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00340788  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.07 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0180  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane  33.33 
 
 
240 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00413997  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.16 
 
 
241 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2966  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.44 
 
 
247 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017508  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.93 
 
 
240 aa  112  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24250  cytochrome c biogenesis protein  35.32 
 
 
267 aa  112  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0600094  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.82 
 
 
244 aa  112  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3204  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35 
 
 
247 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3606  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.41 
 
 
240 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507935  normal  0.590973 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3944  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.41 
 
 
240 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1322  cytochrome c biogenesis protein CcdA  29.32 
 
 
242 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1660  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.03 
 
 
237 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3473  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.12 
 
 
238 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.320099 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1643  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.38 
 
 
249 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0649003  normal  0.267262 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3411  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.12 
 
 
238 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0629  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.87 
 
 
247 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162962  hitchhiker  0.0053075 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.2 
 
 
242 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.32 
 
 
244 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4103  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.45 
 
 
242 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1553  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.47 
 
 
247 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1840  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35 
 
 
249 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3738  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.92 
 
 
246 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0812643  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1617  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.33 
 
 
244 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.217228  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2162  cytochrome c-type biogenesis protein  32.35 
 
 
248 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20604  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.46 
 
 
244 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1953  cytochrome c biogenesis protein  31.85 
 
 
244 aa  102  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.66 
 
 
231 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.41 
 
 
247 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0584  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  34.47 
 
 
253 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.72 
 
 
244 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4210  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.94 
 
 
245 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0549  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  34.47 
 
 
248 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000031904  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.88 
 
 
244 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0831  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.67 
 
 
224 aa  99.4  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0602188  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4260  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.33 
 
 
247 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0130  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.99 
 
 
228 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2813  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein  35.11 
 
 
244 aa  96.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3455  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.34 
 
 
235 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813514  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3727  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.34 
 
 
235 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3348  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.34 
 
 
235 aa  95.9  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000571426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2317  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.04 
 
 
235 aa  95.9  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000398052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3679  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  27.34 
 
 
235 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3367  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  26.95 
 
 
235 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2128  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.47 
 
 
235 aa  95.5  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.32 
 
 
247 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132104  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>