212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2703 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2703  putative cytochrome C biogenesis membrane protein  100 
 
 
270 aa  517  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.524164  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5009  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  70.26 
 
 
268 aa  344  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.082972  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4430  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  62.83 
 
 
253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0270  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  57.99 
 
 
243 aa  267  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  52.43 
 
 
274 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0573  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  59.85 
 
 
244 aa  252  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0502  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  54.09 
 
 
253 aa  249  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0522  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  47.01 
 
 
258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0219549  hitchhiker  0.00315047 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0252  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  51.52 
 
 
255 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4562  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  51.3 
 
 
291 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2199  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  49.45 
 
 
276 aa  212  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4572  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  55.83 
 
 
272 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0445  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  49.63 
 
 
250 aa  209  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.362789  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  48.51 
 
 
249 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  48.51 
 
 
249 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  48.51 
 
 
249 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3291  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  46.95 
 
 
251 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402635  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0511  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  44.1 
 
 
311 aa  206  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.166035  normal  0.182219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3090  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.18 
 
 
251 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3253  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  49.63 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0400175  normal  0.222904 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4519  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  45.49 
 
 
249 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0363531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0826  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  48.02 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4432  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.86 
 
 
266 aa  188  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229211  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6714  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  48.82 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07210  cytochrome c biogenesis protein  46.64 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.276836 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0690  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  44.02 
 
 
261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4517  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  45.16 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.321232  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24250  cytochrome c biogenesis protein  45.78 
 
 
267 aa  178  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0600094  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0693  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.11 
 
 
259 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0706  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.11 
 
 
259 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.10539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.11 
 
 
259 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1037  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  45.53 
 
 
276 aa  178  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4097  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  46 
 
 
285 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.326435 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.7 
 
 
270 aa  175  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2733  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.31 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0356838  normal  0.0597692 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17960  cytochrome c biogenesis protein  47.35 
 
 
256 aa  171  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3693  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.83 
 
 
256 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5681  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.44 
 
 
256 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.728105 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2825  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.44 
 
 
257 aa  169  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447777  normal  0.192447 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0927  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.75 
 
 
281 aa  168  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5329  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.68 
 
 
256 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.262903  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5368  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.27 
 
 
278 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428452  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6119  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  52.41 
 
 
342 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551753  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10538  cytochrome C-type biogenesis protein ccdA  41.41 
 
 
259 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000404989  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24340  cytochrome c biogenesis protein  42.7 
 
 
271 aa  165  9e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4485  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  44.83 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1322  cytochrome c biogenesis protein CcdA  38.96 
 
 
242 aa  160  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0867  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  43.16 
 
 
264 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265338  normal  0.0292132 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2672  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.55 
 
 
270 aa  158  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.51 
 
 
244 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0051  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.2 
 
 
261 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0629  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  45.19 
 
 
247 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162962  hitchhiker  0.0053075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.46 
 
 
244 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1457  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.84 
 
 
250 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00340788  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  38.67 
 
 
251 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493199  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.02 
 
 
244 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.89 
 
 
244 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1553  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.19 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.27 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3411  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.6 
 
 
238 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3473  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.2 
 
 
238 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.320099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.4 
 
 
246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02950  cytochrome c biogenesis protein  44.03 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.84 
 
 
244 aa  145  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2451  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.34 
 
 
242 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0258924  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0455  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.89 
 
 
259 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3204  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.63 
 
 
247 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1617  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.83 
 
 
244 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.217228  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3738  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0812643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2284  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.75 
 
 
223 aa  132  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000156188  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4210  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  43.46 
 
 
245 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0831  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.1 
 
 
224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0602188  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0736  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.56 
 
 
222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.592681  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2966  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.77 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017508  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.9 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.55 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0584  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  38.75 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.75 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0549  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  37.97 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000031904  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4103  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.17 
 
 
242 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2134  putative cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  33.59 
 
 
248 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0478142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1384  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.16 
 
 
249 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0107253  normal  0.0935578 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2005  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.82 
 
 
243 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0109812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0808  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.59 
 
 
248 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.13 
 
 
231 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1434  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.97 
 
 
249 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0180  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane  36.86 
 
 
240 aa  122  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00413997  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2813  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein  40 
 
 
244 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0718  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.43 
 
 
248 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4260  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.69 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3645  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.97 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2222  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.51 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1951  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.94 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.68 
 
 
229 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1771  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.29 
 
 
245 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.5 
 
 
240 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2162  cytochrome c-type biogenesis protein  37.7 
 
 
248 aa  118  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1660  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.27 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.76 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.965188  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0753  putative cytochrome c-type biogenesis protein  36.63 
 
 
250 aa  116  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.117718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>