25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1444 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1444  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  100 
 
 		 332 aa  678    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1361  hypothetical protein  51.22 
 
 		 188 aa  218  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0012643  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2027  hypothetical protein  51.47 
 
 		 189 aa  209  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.968984  normal  0.751952 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2221  hypothetical protein  47.98 
 
 		 208 aa  188  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0458  conserved hypothetical protein-like protein  46.77 
 
 		 213 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1630  hypothetical protein  45.85 
 
 		 204 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.856032  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1028  hypothetical protein  43.69 
 
 		 203 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0861228 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0137  hypothetical protein  55.86 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0023  hypothetical protein  41.09 
 
 		 197 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2355  hypothetical protein  41.38 
 
 		 188 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0178  hypothetical protein  45.28 
 
 		 200 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0520859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2541  hypothetical protein  45.95 
 
 		 191 aa  146  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0624  hypothetical protein  38.7 
 
 		 550 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1660  hypothetical protein  39.32 
 
 		 201 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000145701  hitchhiker  0.0000000000565897 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3083  hypothetical protein  46.58 
 
 		 615 aa  140  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0545  hypothetical protein  48.32 
 
 		 556 aa  138  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0168127  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1432  hypothetical protein  45.16 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0804678 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2419  hypothetical protein  45.21 
 
 		 520 aa  136  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.226401 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5195  conserved hypothetical protein-like protein  45.21 
 
 		 617 aa  133  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1373  hypothetical protein  33.48 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1487  hypothetical protein  34.46 
 
 		 282 aa  93.2  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.204521  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1249  hypothetical protein  29.58 
 
 		 252 aa  89.4  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1677  hypothetical protein  27.83 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2102  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.68 
 
 		 237 aa  67  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0513  hypothetical protein  28.32 
 
 		 232 aa  47  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.651674  normal  0.711601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>