26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2102 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2102  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  100 
 
 
237 aa  477  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1677  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1249  hypothetical protein  32.44 
 
 
252 aa  99  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0513  hypothetical protein  31.49 
 
 
232 aa  95.1  8e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.651674  normal  0.711601 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1432  hypothetical protein  30.53 
 
 
289 aa  94.4  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0804678 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3083  hypothetical protein  38.36 
 
 
615 aa  82  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0624  hypothetical protein  40.41 
 
 
550 aa  79.7  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802185  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1373  hypothetical protein  26.24 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2419  hypothetical protein  37.76 
 
 
520 aa  76.3  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.226401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2541  hypothetical protein  35.17 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5195  conserved hypothetical protein-like protein  36.3 
 
 
617 aa  74.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1630  hypothetical protein  33.56 
 
 
204 aa  74.7  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.856032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2027  hypothetical protein  36.11 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.968984  normal  0.751952 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1487  hypothetical protein  24.83 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.204521  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2355  hypothetical protein  35.76 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1028  hypothetical protein  30.95 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0861228 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0545  hypothetical protein  36.3 
 
 
556 aa  69.7  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0168127  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1361  hypothetical protein  31.41 
 
 
188 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0012643  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2221  hypothetical protein  32.41 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1444  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  32.68 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0458  conserved hypothetical protein-like protein  31.25 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0178  hypothetical protein  34.48 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0520859  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1660  hypothetical protein  32.19 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000145701  hitchhiker  0.0000000000565897 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0137  hypothetical protein  33.8 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0023  hypothetical protein  31.82 
 
 
197 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0596  hypothetical protein  21.03 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0844954  normal  0.105487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>